Hacia el final del enfrentamiento, el USS Metacomet la persiguió, pero logró ahuyentarla.
El Morgan, tratando de evitar la captura, luego giró hacia aguas poco profundas, encalló brevemente, pero continuó su peligrosa ruta y alcanzó los cañones en Fort Morgan.
Cuando la victoria de la Unión fue evidente, el capitán Harrison inicialmente quería hundir el barco, pero fue persuadido por su segundo al mando, el teniente Thomas Locke Harrison (sin relación) de que podía salvarse corriendo audazmente el guante hasta Mobile.
Aunque perseguido y bombardeado con vehemencia por cruceros durante gran parte del viaje de 25 millas a la luz de las estrellas, llegó a las obstrucciones exteriores cerca de Mobile al amanecer, y esa tarde se le permitió pasar.
Fue comandado por el Capitán Fry y sufrió daños considerables en su batalla final, pero sobrevivió a la guerra.