Desapareció en el verano de 2008, al no poder inscribirse una nueva temporada en la Liga LEB por problemas financieros.

En 1984 dio paso al Caja Huelva,[2]​ que logró ascender en la temporada de su debut (1984/85) con una plantilla compuesta netamente por jugadores onubenses.

El estreno onubense en la segunda categoría nacional se produjo en la temporada 1988/89, ese año llegó el primer extranjero en la historia del club, el Ala-Pívot norteamericano Voise Winters; tras un primer año complicado, el Caja Huelva desciende de nuevo a Segunda División tras perder (3-2) en un ajustado playoff por la permanencia ante el Obradoiro.

La temporada 1989/90 comienza con la feliz noticia de que el Caja Huelva es repescado para jugar en Primera "B"; el equipo onubense realiza una gran campaña y con el puertorriqueño Jerome Mincy logra clasificarse por primera vez en su historia para el playoff de ascenso a la Liga ACB, pero cayó en el playoff ante un verdugo conocido, el Obradoiro.

Con jugadores como el onubense Miguel Ángel Vilchez o el estadounidense Tom Gneiting y el técnico Juan Llaneza, el Monte Huelva disputa sus terceros playoffs consecutivos buscando la Liga ACB, siendo eliminados por el Prohaci Mallorca.

En la campaña 1993/94, el Monte Huelva le confía el banquillo al recién retirado Quino Salvo con Sergio Valdeolmillos como su segundo; el técnico vigués guía al equipo a sus quintos playoffs de ascenso consecutivos, siendo eliminados por el Sant Josep de Badalona.

Tras una campaña irregular, el Monte Huelva venció en los playoffs por la permanencia al Caja San Fernando, eludiendo así el descenso de categoría.

La temporada 1995/96 fue la última del club como Monte Huelva, con la llegada del carismático Ray Smith y una masa social cada vez más importante, el cuadro onubense completa una buena temporada y se clasifica para disputar la fase de ascenso en Lugo sin premio.

El estreno del nuevo club se produciría en una categoría que también iba a ver la luz ese año, la Liga LEB.

El CB Huelva realizó una gran fase regular y se clasificó para disputar la Copa Príncipe de Asturias en Torrelavega, aunque cayó en semifinales ante el Gijón Baloncesto.

Onubenses y andorranos se jugarían un puesto para la siguiente temporada en la Liga ACB, los dos equipos ganaron los dos enfrentamientos en sus canchas y todo se decidiría en el quinto partido de la serie, un Andrés Estrada abarrotado llevó en volandas a su equipo que ganó 76-73 el fatídico partido.

Sin embargo, el CB Ciudad de Huelva perdió los 4 siguientes partidos, finalizando la primera vuelta en la última posición con el paupérrimo bagaje de 2 victorias y 15 derrotas, lo que propició la destitución del técnico Sergio Valdeolmillos, pasando José María Oleart a encabezar el banquillo onubense.

El Ciudad de Huelva había conseguido en un par de semanas lo mismo que en toda la primera vuelta, pero todos los sectores del club sabían que era prácticamente inevitable disputar el playoff por la permanencia; aun así, el equipo onubense logró su quinta victoria en la 24.ª jornada ante el Caja San Fernando (85-84), logrando salir de la última posición en la que estaba instalado desde hace meses; en la siguiente jornada, una nueva victoria en la pista del Caja Cantabria (80-81) le dejó a un partido de tener el factor cancha a favor en los playoffs, pero volvió a encadenar varias derrotas consecutivas que le situaron a 4 jornadas del final en la última posición y a dos partidos del Ourense, penúltimo.

El equipo onubense recuperaba el factor cancha y, aunque perdió el segundo partido fuera (84-78), tendría la posibilidad de lograr la salvación en el Andrés Estrada.

Pese a reformar el pabellón para satisfacer las peticiones de la ACB, era una realidad que Huelva necesitaba un complejo deportivo nuevo.

El curso 2004/05 empezaba con serias dudas; un CB Ciudad de Huelva joven y muy reformado le confiaba el banquillo a Joaquim Costa, que hasta entonces había sido segundo de Aíto García Reneses en el Barcelona pero que no tenía experiencia como primer entrenador.

El rival definitivo para luchar por una plaza para la Liga ACB sería el Baloncesto Fuenlabrada; el potente equipo madrileño ganó en casa el primer partido (79-70), pero el Ciudad de Huelva conquistaría el Polideportivo Fernando Martín en el segundo choque (81-85); la eliminatoria se fue a Huelva empatada a uno.

Sin embargo, el CB Ciudad de Huelva completó una desastrosa segunda vuelta, en la que solo sumó 4 victorias por 13 derrotas, lo que le condenó a luchar por la permanencia en una seria contra el Aguas de Calpe; el equipo onubense pudo salvar la categoría al vencer en la eliminatoria por un contundente 3-0.

La empresa era complicada, pues el rival era el Alerta Cantabria Lobos, que conquistó la liga regular con brillantez (23 victorias y 11 derrotas); el equipo cántabro logró el primer punto de la serie en casa (74-67), pero el Ciudad de Huelva dio la sorpresa y ganó el segundo enfrentamiento (69-78).