Posteriormente fue transferido a la Universidad de Oklahoma State, donde fue seleccionado en el segundo quinteto de la Big Eight Conference en 1993 y en el primer quinteto al año siguiente.
Thompson lideró a los Cowboys en asistencias en ambas temporadas y promedió 16.9 puntos por partido como sénior.
En los Nuggets se mantuvo hasta final de temporada, aportando 6.8 puntos en 16.1 minutos.
En las dos siguientes temporadas trabajó como entrenador asistente en Southeastern Louisiana y en Oklahoma State.
Desde 2002 hasta 2004 entrenó al Yavapai College, liderando al equipo a un récord de 28-7 en la campaña 2002-03 y obteniendo la clasificación para el torneo de la NJCAA, donde finalizaron undécimos en el rango nacional.