[3]​ Se encuentra en el centro del estado, a orillas del río Misuri.

Boonville se encuentra ubicada en las coordenadas 38°57′23″N 92°45′4″O / 38.95639, -92.75111.

Según la Oficina del Censo de los Estados Unidos, Boonville tiene una superficie total de 18.67 km², de la cual 17.84 km² corresponden a tierra firme y (4.44%) 0.83 km² es agua.

[4]​ Según el censo de 2010,[5]​ había 8319 personas residiendo en Boonville.

De los 8319 habitantes, Boonville estaba compuesto por el 83.12% blancos, el 13.33% eran afroamericanos, el 0.4% eran amerindios, el 0.56% eran asiáticos, el 0.04% eran isleños del Pacífico, el 0.3% eran de otras razas y el 2.25% pertenecían a dos o más razas.