La ciudad es lo suficientemente pequeña como para que la mayoría de los lugares se encuentren a poca distancia.
Se puede acceder a Bocas del Toro por aire o por vía marítima.
Las islas e islotes en el archipiélago de Bocas del Toro son accesibles solo en bote privado o taxi acuático.
Muchas comunidades pequeñas bordean la hilera de islas y muy pocas tienen carreteras.
Muchas empresas brindan servicio de botes a varias islas y lugares para bucear.