[1] Estudió en centros educativos de orientación católica: St.
Matthews y Junípero Serra High School en San Mateo, California.
Tras graduarse en el Pomona College en 1970 donde había comenzado su carrera periodística al fundar un periódico independiente llamado de The Collegian (más tarde llamado The Collage), fue reportero en Portland en The Oregonian, el Congressional Quarterly Weekly Report y en The Dallas Times Herald.
Keller se unió a The New York Times en abril de 1984 como corresponsal nacional con sede en la oficina de Washington.
[2] Desde julio de 2003 es el editor de The New York Times, posición que decide abandonar para dedicarse tiempo completo en la redacción del diario.