La obra de Shapiro se ha centrado en el análisis del ADN antiguo.

[11]​ Estudió chino mandarín, español, literatura en lengua inglesa, y geología, posteriormente eligiendo la ecología como su major,[9]​ Se graduó con el summa cum laude en 1999, con un bachiller de letras y una maestría en artes en ecología.

[9]​[5]​ Ese año se le otorgó una Beca Rhodes[10]​ y después obtuvo un Ph.D.

[12]​ El mismo año fue nombrada directora del Biomolecules Centre Oxford Henry Wellcome, ocupando dicho puesto hasta el 2007.

[13]​[14]​ La obra de Shapiro en el tema de la ecología ha sido publicada en varias revistas científicas notables, como lo son[1]​ Molecular Biology and Evolution,[15]​ PLOS Biology,[16]​ Science[13]​[17]​[18]​ y Nature.