La M3 tiene capacidad para un máximo de ocho cartuchos y usa el sistema de tiro semiautomático patentado por Benelli usado por primera vez en la M1.
La M3 destaca por permitir al usuario la opción de disparar en modo semiautomático o en acción de bombeo (empujar el guardamanos hacia atrás y luego hacia delante).
El depósito tubular situado bajo el cañón normalmente contiene 8 cartuchos en las versiones militares o policiales y algunos menos en las versiones civiles.
La M3 Super 90 está disponible en diversas longitudes de cañón y en varias opciones de culata, con culata fija y empuñadura de "semi-pistola" o culata plegable y pistolete.
También existe una versión recortada - más sencilla de transportar - usada por la policía.