La sección de balonmano del Bayern Múnich fue creada en agosto de 1945.
En agosto de 1945, la reunión inaugural se llevó a cabo; el primer jefe de departamento era Erwin Kienzl.
Como centro de formación inicialmente tuvo lugar en el Bogenhausener Zaubzerstraße.
El departamento recibió grandes audiencias.
Al final de 1946 ya contaba con más de 50 miembros y puso tres equipos de hombres y un equipo juvenil.