En 1969 la estación fue cerrada al ser creada la Base Casey a 2 km de ella.

Se necesitó una cuadrilla de más de 100 personas para erigir la estación que albergó a 24 miembros del personal naval y científicos durante los próximos 18 meses.

Ya que en ese momento estaba en auge la Guerra Fría, había una considerable preocupación por Estados Unidos y Australia sobre la actividad de la Unión Soviética en la Antártida, y se pensó en establecer una base cercana al polo magnético sur.

Para 1964 los edificios se habían convertido en un peligro de incendio debido a la filtración de combustible, y la estación estaba enterrada por la nieve y el hielo.

La Base Wilkes está ahora casi permanentemente congelada en hielo y solo ocasionalmente se revela durante un gran deshielo cada cuatro o cinco años.