[1] Los terrenos sobre los que se construyen la iglesia y el convento fueron entregados a la orden por el gran maestre Pierre de Monte.
Girolamo Cassar fue el encargado de redactar los planos.
Fue dedicada a Nuestra Señora del Refugio Seguro debido a la gran cantidad de marineros que acudían a la pequeña capilla que los dominicos habían construido antes de la construcción de la gran iglesia para agradecer a la Madre de Dios por su regreso a salvo a puerto después de largos y peligrosos viajes por mar.
También se declaró que la parroquia de Santo Domingo sería la iglesia parroquial principal de la ciudad.
Se construyó una nueva iglesia en el mismo sitio de la iglesia original unos 25 años después de su cierre.