[9] Milita desde 2021 en la Primera Federación, tercera categoría del fútbol español en sustitución de la extinta Segunda División "B".Tras un único año en la máxima categoría, el CD Condal retomó su filiación con el F. C. Barcelona, jugando durante 15 años a caballo entre Segunda y Tercera División.Durante tres temporadas el CD Condal y el Atlético Cataluña CF compitieron de forma fratricida en Tercera División, sin lograr ninguno el ascenso a Segunda.[13] Joaquín Labuena, expresidente del Condal y fundador de la SD España Industrial, asumió la vicepresidencia.Se inició entonces una nueva etapa, con Luis Aloy en el banquillo, quien consiguió dos ascensos consecutivos, llevando el equipo a debutar en Segunda División.En la plantilla figuraban los jugadores Antonio Olmo, Tente Sánchez y Paco Martínez, que posteriormente ganarían varios títulos nacionales e internacionales con el primer equipo; los dos primeros, además, fueron mundialistas con la selección española.Esa temporada también jugaron en el filial Pepe Moré y Rusky, que posteriormente tuvieron una larga carrera en Primera División con el Real Valladolid.El Barcelona Atlético perdió la categoría después de tres temporadas, bajando a la recién creada Segunda División B.En los años 1980 el Barcelona Atlètic se consolidó en Segunda División, encadenando siete temporadas consecutivas en esta categoría (1982-1989), su récord hasta la fecha.Durante los años 1990, el filial azulgrana, dirigido por Quique Costas, jugó en Segunda División, hasta que descendió en 1997 con Juande Ramos en el banquillo.[17] De aquel equipo destacan futbolistas como Sergio Busquets, Pedro, Jeffren Suárez, Alberto Botía, Víctor Sánchez o Chico.[20][21] En la temporada 2010-11, el filial barcelonista completa su mejor campaña de la historia, acabando en tercera posición en Segunda División.[22][23] Para la temporada 2011-12, se producen varios cambios en el equipo, empezando por el técnico: Eusebio Sacristán sustituye a un Luis Enrique que fichó por la A.S.[28] Tras este fracaso, el club optó por rescindir el contrato de Jordi Vinyals[29] y Gerard López fue nombrado nuevo técnico.
