Su sede central estuvo situada en San Sebastián y contaba con oficinas en Guipúzcoa, Vizcaya, Álava, Navarra, La Rioja y Madrid.Tras ser adquirida al grupo francés Crédit Agricole, se incorporó al grupo Abanca en enero de 2021,[2] y en noviembre del mismo año se produjo su integración total.En 1997, Bankoa fue adquirido por el grupo financiero francés Crédit Agricole, a través de su caja de ahorros asociada Caisse Régionale Pyrénées Gascogne que se hizo con más del 98% del capital social de Bankoa.[4] Finalmente, Crédit Agricole rehusó continuar con el proceso de fusión.Este grupo opera en el País Vasco, Navarra y La Rioja con la marca Bankoa Abanca.