El estado fue uno de los primeros en legislar una bandera subnacional para dar identidad a los queretanos.

Existe el antecedente de otra bandera desconocida que está en un cuadro del escudo del estado de Querétaro, donde aparece la bandera nacional del lado siniestro y una bandera roja y gualdo en el lado diestro.

[3]​ También se tiene la bandera estatal en forma de banderola, que retoma los color azul marino y oro del estado, pero su simbología está en los bordados de oro del escudo estatal.

El azul también es utilizado en repetidas ocasiones, como la matrícula de placas, la bandera del estado y en banderolas sobre las calles del centro histórico.

Se proporcionan equivalencias aproximadas en otros sistemas de color: