La bandera de la ciudad de Milagro y del cantón Milagro se define el 26 de agosto de 1960 en el Consejo Cantonal de Milagro, presidido por Vicente Concha Pingel.
Se compone de un rectángulo de proporción 1:2 que se divide en dos rectángulos iguales:[1] En la esquina superior izquierda se encuentran cinco estrellas rojas, que representan la parroquias que integran el Cantón Milagro.
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