Las tierras más cercana son las pequeñas Islas Agalega (una islas a las afueras de Mauricio), a unos 300 km más al oeste, seguido de la sureña isla de las Seychelles llamada Coëtivy, unos 400 km al noroeste.
Si el Banco Sur fuera reconocido como un atolón sumergido, sería el más grande del mundo, casi tres veces el tamaño del Gran Banco de Chagos, comúnmente considerado el más grande atolón del mundo.
El Banco Sur y el Gran Banco de Chagos fueron una sola estructura hasta hace unos 64 a 69 millones de años atrás, cuando una cordillera oceánica se abrió entre ellas y las separó.
Están dispuestos en forma semicircular, en torno a un espacio, la antigua laguna, a unos 73 m de profundidad, la cual se inclina en el sureste.
Debido a su localización remota, el Banco se encuentra entre las ecorregiones marinas someras menos estudiadas del planeta.