Las relaciones entre Azerbaiyán y la Cooperación económica del Mar Negro se establecieron tras la recuperación de la independencia por Azerbaiyán, concretamente el 25 de junio de 1992, cuando se firmó el acuerdo sobre cooperación económica del mar Caspio entre 11 estados.
El secretario general de la organización económica del Mar Negro es Michael Christides.
Un año después, en 1997, en Estambul, en la conferencia de la organización sobre el tema "Nuevas oportunidades de la región del Mar Negro" participó y intervino Heydar Aliyev.
La estrecha cooperación entre los estados-miembros de la organización todavía existe, pero los conflictos (Azerbaiyán - Armenia, Rusia - Georgia, Grecia - Turquía) y crisis económica debilitaron las relaciones.
Azerbaiyán está representada en los siguientes órganos de la organización económica del Mar Negro: 1.