Está presidido por el alcalde de Algeciras, que desde 1979 es elegido democráticamente por sufragio universal.

Por Real orden la corporación municipal de Algeciras debía estar formada por alcalde mayor, cuatro regidores, procurador síndico y dos Alguaciles nombrados todos por el comandante general del Campo de Gibraltar, Francisco de Paula Bucareli y Ursúa, excepto el alcalde mayor que debía ser nombrado por el rey.

De esta manera el primer ayuntamiento estuvo presidido provisionalmente por Clemente Félix Guillén hasta que fue asignado alcalde el vecino Francisco Bermúdez Salcedo.

Pedro Monge, José Saenz, Francisco Peña y Juan Valerio fueron nombrados regidores, Gerónimo Aranda fue nombrado procurador síndico general y Juan Tomás Maldonado Alguacil Mayor.

Se nombró entonces a Juan Suárez y se realizaron cinco elecciones municipales hasta el 14 de agosto de 1823 cuando las tropas absolutistas ocuparon la ciudad y restituyeron al anterior alcalde.

En 1887 el arquitecto Amadeo Rodríguez y Rodríguez presentó una modificación de su proyecto anterior eliminando todo detalle de lujo que, según la corporación municipal, encarecía la obra.

En la misma toma de posesión el secretario del Ayuntamiento tomó la palabra para dar lectura a un comunicado remitido por el Gobierno Civil de Cádiz en el que se nombraba por Real Orden como alcalde al concejal Emilio Santacana y Mensayas, que ya había sido alcalde en 1893.

Tras esto la Corporación municipal algecireña presentó su dimisión el 15 de febrero, siendo sustituido por una corporación provisional y después, mediante Real Orden, por un nuevo ayuntamiento presidido por Emilio Morilla Salinas.

Siendo este alcalde se produjo el levantamiento militar del general Franco por lo que el 17 de julio dejó su puesto para ser reemplazado por Salvador Montesinos Díez.

En Algeciras vinieron precedidas por la dimisión del alcalde José Ángel Cadelo Rivera que prepararía así su candidatura con Unión de Centro Democrático (UD) y otros dos concejales, Alberto González Amador que se presentaría por Coalición Democrática (CD) y Francisco Esteban Bautista que lo haría por el Partido Comunista de España (PCE).

Así, el ayuntamiento estuvo presidido por Francisco Bravo García que había sido concejal de Hacienda.