Augusto Felipe nació el 11 de noviembre de 1612 en Sønderborg en la isla de Als en el Ducado de Schleswig.

[1]​ Fue el quinto hijo del duque Alejandro de Schleswig-Holstein-Sonderburg (1573-1627) y de su esposa Dorotea de Schwarzburg-Sondershausen (1579-1639).

Su hijo Federico Luis le sucedió.

En 1645 contrajo matrimonio con Clara de Oldemburgo (1606-1647), (hija del conde Antonio II de Delmenhorst), miembro de una rama antigua de la casa de Oldemburgo.

Viudo, Augusto se casó por segunda vez en junio de 1649 Sidonia de Oldenburgo (1611-1650), abadesa de Herford (1640-1649), con la que tuvo una sola hija: Viudo por segunda vez, el 12 de abril de 1651 contrajo terceras nupcias en Beck con Sibila de Nassau-Sarrebrück (1628-1699) (hija del conde Guillermo de Nassau-Sarrebrück), y de esa unión tuvo 10 hijos: