De su obra solo se conservan cinco atlas iluminados, con fechas comprendidas entre 1568 y 15801.
Se sabe a ciencia cierta que dos de los atlas fueron dibujados en Goa, aunque otros dos probablemente también lo fueran.
A partir de estas imágenes se elaboraron nuevas versiones por todo el mundo.
En 2012, el sello español M. Moleiro Editor publicó la primera y única reproducción facsímil del Atlas universal de Fernão Vaz Dourado, en una edición limitada a 987 ejemplares.
1) João Carlos Garcia, «O Atlas Universal atribuido a Fernão Vaz Dourado», Biblioteca Nacional de Portugal.