[cita requerida] En 1943 logró el ascenso a la primera división de la Asociación Córdobesa de Básquetbol,[cita requerida] y en 1948 se consagró campeón con un equipo integrado por Juan Aird, Alberto Andrizzi, Jorge Asrín, Pedro Bustos, Raúl Carrión, Miguel Correa, Italo Giannone, Aarón Glastein, Juan Peñalosa, Alejandro Romero, Raúl Vallejos y Julio Viñas.

Sus jugadores más destacados en ese período fueron Pedro Bustos, quien formó parte del equipo argentino que conquistó el primer Campeonato Mundial de Baloncesto en 1950, Jorge Martínez y Alejandro Romero.

[30]​ Tras perder la semifinal disputó el partido por el tercer puesto ante el local PSG Racing, al cual venció 88 a 78 y con ello Atenas logró la medalla de bronce.

Atenas ganó todos, los seis encuentros,[34]​ y en Liga Nacional quedó como el mejor equipo al cabo de la fase regular.

En esta temporada el club junto con la empresa televisiva ESPN crearon el «Atenas International Tournament», un torneo cuadrangular de pretemporada que se disputó en Córdoba.

Luego disputó solamente la Liga Nacional, donde en la primera fase logró 22 victorias en 30 partidos, quedando como el mejor equipo de esa etapa.

El equipo integrado por, entre otros, Marcelo Milanesio, Héctor Campana, Diego Osella, Leandro Palladino, Leonardo Gutiérrez y Bruno Lábaque, partió como candidato al título.

Tras cinco partidos en ese grupo, con dos victorias y tres derrotas, Atenas viajó a Valdivia para disputar el Sudamericano de Clubes Campeones.

[237]​ Las semifinales fueron ante Boca Juniors, con desventaja de cancha, por ello el primer juego fue en Córdoba, donde se impuso 114 a 109, tras ir perdiendo al cabo del segundo cuarto por 17 puntos.

[240]​ El desquite fue en La Bombonerita, donde Boca empató la serie al vapulear 93 a 49, siendo uno de los juegos con menor goleo para el elenco cordobés y una derrota por tanta dferencia.

El tercer cuarto fue más peleado pero pudo mantener la ventaja, tal que al inicio del último período esta fuera de 8 puntos.

[321]​ El equipo estuvo conformado por Bruno Lábaque, Leonel Schattmann, William Mc Farlan, Terry Taylor, Diego Osella, Fernando Malara, Cristian Romero y Juan Pablo Figueroa.

[335]​ En las semifinales se emparejó con Boca Juniors, cuarto de la zona sur, en un encuentro que también llegó al tiempo suplementario, pero esta vez perdió (99 a 102) y quedó eliminado del torneo.

[338]​ Luego fue cortado dicho jugador y el equipo disputó algunas fechas sin esa ficha extranjera, hasta que llegó Terrel Taylor.

[362]​ Bajo nueva conducción, Atenas logró cinco victorias y tres derrotas, marca que lo dejó fuera del Súper 8 de la temporada.

[381]​ Esa fue la única derrota que registró el equipo, pues desde ese momento logró 13 victorias de manera consecutiva y clasificó al Súper 8.

[393]​ En semifinales se emparejó con Sionista al cual venció en tres juegos (80-67,[394]​ 78-67[395]​ y 85-79)[396]​ para así llegar a la final, la primera tras seis años.

[397]​ En la serie definitiva se emparejó con el segundo mejor equipo de la temporada, Peñarol, y los dirigentes griegos lograron cambiar la localía al Orfeo Superdomo, dándole un marco más destacable.

La temporada comenzó con la Copa Argentina, donde Atenas logró cinco victorias en seis partidos pero no pudo avanzar de ronda porque empató en la primera posición con Sionista y el desempate favoreció al equipo entrerriano.

[463]​ Antes del comienzo de la Liga Nacional Osborne dejó el equipo y fue reemplazado por Jeremiah Wilson, mientras que también se sumó Roberto Gabini.

[466]​[467]​ Atenas comenzó con el pie izquierdo la temporada pues se lesionó Gabini[468]​ y tuvieron que buscarle reemplazo, contratando al extranjero Asim McQuenn.

[486]​ En semifinales se enfrentó a la revelación, Quimsa, que llegó desde la reclasificación y en el caminó dejó al mejor equipo de la fase regular, Obras Sanitarias.

[512]​ La segunda ronda el equipo no logró victorias en las cuatro primeras presentaciones, llegando a ocho derrotas consecutivas, y el entrenador Sebastián González fue reemplazado por Néstor «Che» García.

[525]​ El equipo se conformó con Bruno Lábaque, Javier Bulfoni, Diego Guaita, Julián Aprea, Mariano Fierro, Alexis Elsener, Hernán Colli y Román González, más el único extranjero Robert Hornsby.

Con apenas cuatro partidos disputados, de los cuales solo ganó uno, Marcelo Arrigoni dejó la dirección del equipo y fue reemplazado por Pablo D'Angelo.

El plantel griego estuvo conformado por Bruno Labaque, Diego Gerbaudo, Luciano González, Juan Manuel Rivero, Diego Lo Grippo, Gabriel Mikulas, Juan Manuel Torres, los sub-23 Mauricio Corzo y Robert Sampson, también extranjero, los juveniles Agustín Mas Delfino, Franco Baralle, Jonathan Basualdo, Mateo Chiarini, Lautaro Mare, Agustín Pautasso, Mateo Battistino y Leonardo Lema, más el extranjero mayor Omar Reed.

[562]​ Bajo el mando del nuevo entrenador el equipo cosechó veintitrés victorias en treinta y ocho presentaciones, pero por el mal arranque de temporada no pudo acceder a los play-offs, quedando octavo en la zona norte.

A lo largo de su historia, Atenas ha sido patrocinado por Topper, Run Up, team foot, TBS, Puma, Nike, RSP, Peak y Adhoc.

Las principales figuras que obtuvieron numerosos títulos y trofeos para la Institución fueron: Corsino Fernández, Eduardo Montes de Oca, Aníbal Barrionuevo, Carlos Yantorno, Maximiliano Guerra, Alcides Desio, Pablo Barión, Alcides Muela, Wadid Simes, Ángel Mazzeo, Jorge Álvarez, Pedro Arocena, René Conci, Emilio y Edgardo Mazzeo entre otros.

En la rama femenina se destacaron: Alejandra Fundaró, Cecilia Farías, Mabel Martínez, Liliana Propatto, Ana Bertero, Graciela y Adriana Mamani.