Fue el hijo del undécimo shogun Ashikaga Yoshizumi.En 1521 hubo una lucha del poder entre Ashikaga Yoshitane y Hosokawa Takakuni, Yoshitane huyó a la isla Awaji y Yoshiharu se convertiría en shogun, no obstante era un gobernante títere.Su ausencia de poder político y las constantes expulsiones que sufría fuera de Kioto lo obligaron a abdicar en 1546, en medio de una lucha entre Miyoshi Nagayoshi y Hosokawa Harumoto.Sería sucedido por su hijo Ashikaga Yoshiteru.También su otro hijo Ashikaga Yoshiaki sería el decimoquinto y último shogun.
