En el se custodian unos 75.000 legajos que ocupan casi 16.000 metros lineales de estanterías.

[2]​ Para modernizar y unificar criterios con sentido más moderno de los temas a archivar se modificaron los capítulos en los que estaba dividido el archivo original y en la actualidad tiene las siguientes secciones de fondos:[3]​ Tiene un total de 3 769 legajos que se referían a las competencias que tenía la «Secretaría de Estado y Despacho de Guerra» que posteriormente pasó a ser un Ministerio.

Los expedientes que tramitaba eran los relativos a fronteras y embajadas, academias y centros de enseñanza, armamento, contabilidad, hospitales, recompensas, organización de regimientos, uniformes, etc.

En este organismo se tramitaban diferentes expedientes administrativos tales como: pensiones, retiros, licencias de matrimonio así como las causas judiciales de personal militar y del civil que estuviese bajo la jurisdicción militar.

Este apartado es una colección de reales cédulas, pragmáticas, circulares, sanciones, decretos, discursos, reglamentos, bandos, declaraciones de guerra, tratados de paz, extradiciones así como las disposiciones jurídicas, administrativas, económicas, políticas, militares, etc.