Dedicado a la apicultura, fue soldado durante la II Guerra Mundial y bajo la ocupación nazi participó en la Armia Krajowa, un grupo de resistencia clandestina organizada.

Trabajando duro para vivir, estudió psicología en la Universidad Jaguelónica de Cracovia con el profesor de psiquiatría Edward Brzezicki, todavía sin censura; posteriormente el dirigismo comunista implantó obligatoriamente las tesis del conductismo pavloviano en psiquiatría.

La opresión del gobierno dirigió su interés hacia la psicopatología, especialmente al papel de los psicópatas en un sistema gubernamental totalitario.

[2]​ Un manuscrito inicial con las conclusiones de este grupo había sido arrojado al fuego minutos antes de una redada de la policía secreta comunista; una segunda copia, reescrita con mucho esfuerzo por estos mismos científicos, fue enviada por correo al Vaticano, pero nunca se acusó recibo y el manuscrito y todos los datos valiosos que contenía se extraviaron y los científicos del grupo fallecieron salvo Lobaczewski, quien con todo lo que recordaba redactó su obra más famosa, Ponerología política, en Nueva York, en 1984.

Pero todos los intentos de publicar el libro entonces fracasaron, obstaculizados por la inteligencia comunista y por Zbigniew Brzezinski.