La película recibió críticas mixtas y fue considerada inferior a las entregas anteriores.

Después de lograr escapar del planetoide LV-426, Ripley, Hicks, Bishop y Rebecca ("Newt") continúan su viaje hacia la Tierra.

Emergency Escape Vehicle, según sus siglas en inglés) en forma automática mientras están dormidos.

El EEV aterriza en un planetoide del anillo exterior, donde se encuentra una colonia penal siderúrgica, convertida en planeta prisión, habitada por prisioneros de tipo cromosoma doble y conocida bajo el nombre de Fiorina "Fury" 161.

Los prisioneros que habitan el planeta prisión son muy peligrosos, criminales, psicópatas, asesinos, considerados lo peor de la humanidad que puede existir, condenados a prisión perpetua por sus crímenes cometidos, ellos se toman el trabajo de recuperar la unidad EEV y, a causa del violento alunizaje, fallecen Newt, ahogada en el criotubo y Hicks, atravesado por un hierro en el momento del violento choque; el androide Bishop queda inoperable y la teniente Ripley es la única superviviente.

Cuando ella recobra el conocimiento en la sala médica del planeta prisión, Clemens, el médico de la prisión, le dice la mala noticia de que sus compañeros no han sobrevivido al aterrizaje.

Durante el transporte del EEV hacia el basurero de la prisión, un Facehugger escapa y ataca a un perro mascota (un buey en la versión extendida), colocándole el Alien en gestación en su cuerpo.

Las autoridades del planeta prisión, solicitan en forma urgente una nave de rescate para llevarse a Ripley, que podría llegar al planeta prisión en una semana, Científicos de la compañía minera espacial se dirigen en camino hacia el planeta prisión para rescatar a Ripley y capturar el espécimen invasor para tener una ventaja en su división de bioarmas.

Ripley junto con los reos intentarán eliminar a la criatura, antes de que sea demasiado tarde.

Los reos intentan eliminarlo con unos líquidos explosivos, pero todo termina en tragedia debido a un accidente.

Es común referirse a ella simplemente como “La Compañía” y en las películas, salvo en Aliens, que es la primera vez que se pone nombre a la compañía, en una breve escena de la Edición Especial de Alien 3 (1992) y una discusión en Alien: Resurrection (1997), el nombre Weyland-Yutani no se menciona o se muestra prominentemente.

En Alien: Resurrection (ambientada 200 años después de Alien 3), descubrimos que la compañía ya no existe y que una fuerza militar conocida como United Systems Military controla ahora todos los aspectos en los que Weyland-Yutani estaba envuelta, especialmente los contratos para desarrollar nuevo armamento, desde los rifles de pulso y cañones inteligentes hasta las bio-armas.

El nombre Weyland-Yutani fue introducido por el director de Alien, Ridley Scott, quien tenía dos viejos vecinos a los que odiaba con pasión, así que decidió nombrar a esta malvada compañía en su honor.