Después de algunos percances, como ser encogida por una poción y agigantada por un pastelillo, Alicia logra salir por la puerta pequeña, llegando a un lugar llamado "Infratierra", un sitio parecido a sus sueños, por lo que ella cree que se trata de otra pesadilla.

Bayard se escabulle debajo de la mesa y llega hasta la tetera, gruñendo.

El Sombrerero decide llevar a la joven al castillo de la Reina Blanca.

Mientras caminan, llegan a un pueblo en ruinas, lugar donde el Jabberwocky atacó, la Reina Blanca perdió su corona y donde el caballero propietario de la Espada Vórpica (la única arma capaz de herir a la criatura) fue asesinado.

Mientras le cuenta su historia, los Caballeros Rojos se aproximan; el Sombrerero salva a Alicia arrojándola junto con su sombrero al otro lado de un río.

Alicia es encontrada por Bayard, quien se arrepiente de sus acciones, pero le dice que debe llevarla ante la Reina Blanca.

Sin embargo, ella se niega y le pide que la guíe hacia el castillo de la Reina Roja para salvar al Sombrerero.

Alicia ve a la reina jugando croquet con sus súbditos (que tienen partes de su cuerpo más grandes).

La chica se encuentra con el Conejo Blanco, quien le da un trozo del pastelillo que la hizo crecer; sin embargo, se excede en la cantidad que consume y termina creciendo de forma desmesurada, sobresaliendo de los arbustos y siendo descubierta por la Reina Roja.

La reina le pregunta por su prisionero, y él responde que no ha revelado nada.

Mientras tanto, Bayard se dirige al Castillo de la Reina Blanca, Mirana, quien es una mujer bondadosa y dedicada.

En el castillo de la Reina Roja, Alicia encuentra al Sombrerero fabricando sombreros.

Alicia camina por los pasillos del castillo y se topa con los Tweedles, quienes la llevan con el conejo.

La llave para abrir el baúl donde está la espada cuelga del cuello de la bestia.

Al quitarse la venda, ve que la lesión empeoró y se queda dormida ahí.

Por la mañana, Alicia despierta y logra quitarle la llave al Bandersnatch, quien, además, lame su rasguño curándoselo.

Mirana la insta a tomar su propia decisión, pues si pelea, tendrá que hacerlo sola.

Alicia, aún indecisa, se aparta para pensar y se dirige a un sector del castillo donde está Absolem, ya casi totalmente en su capullo, y él le dice que entenderá qué hacer cuando sepa quién es en realidad.

Antes de envolverse por completo en el capullo, Absolem le indica que se aferre a la espada, pues conoce bien sus propios deseos.

Sin embargo, la chica llega armada con la Espada Vórpica y montada en el Bandersnatch.

Ya en el campo, la Reina Blanca intenta razonar con su hermana, pero no lo logra, así que Iracebeth llama al Jabberwocky, un dragón capaz de hablar y lanzar rayos morados con su aliento.

Viendo esto, la Reina Roja ordena a sus tropas pelear, e Ilosovic se enfrenta al Sombrerero.

Finalmente, sube hasta la cima de una antigua torre, donde el dragón casi la atrapa.

El Jabberwocky lanza a Alicia por los aires, pero ella, antes de caer, grita “Perderás la cabeza” y lo decapita con la Espada Vórpica.

El rodaje se había programado para mayo del 2008, pero no empezó hasta septiembre y concluyó tres meses después.

[14]​ James Cameron, quien lanzó su película Avatar en 3D, criticó la elección de Burton diciendo que «no tiene ningún sentido rodar en 2D para luego convertirlo a 3D».

Sus planes para mostrar la película en España, Alemania, Portugal y Austria tampoco se vieron afectados.

Alice in Wonderland abrió en el número uno con más de $ 41 millones en América del Norte, estableciendo un nuevo récord para una primera jornada en marzo.

La página Metacritic le ha dado una puntuación de 53, basada en 38 reseñas, indicando "críticas mixtas".

Los temas que contiene el disco Almost Alice son los siguientes: Premios Óscar:[16]​ Premios Globo de Oro:[17]​ Se anunció la película Alicia a través del espejo, cuyo estreno tuvo lugar en mayo de 2016.