Sin embargo, al final de la película, Spence, que estaba teniendo una relación amorosa real con Alice mientras fingía ser su marido, revela que había robado muestras del T-Virus con la intención de venderlas en el mercado negro, liberando el virus en la Colmena para cubrir sus huellas.

Rain, a pesar de habérsele dado el antivirus, ya se había vuelto de todos modos una zombi y es finalmente asesinada por Matt, ya que la batalla del Licker comienza en el tren en movimiento.

Se explica que ha adoptado características sobrehumanas; como mayor fuerza, velocidad y agilidad.

Más tarde, un equipo dirigido por el Dr. Isaacs, de Umbrella, encuentra a Alice supuestamente muerta en los restos del helicóptero.

Afortunadamente, ella es capaz de encenderse, "friendo" el procesador del satélite con sus poderes mentales avanzados.

Los dos luchan usando sus mutaciones que el virus T les ha otorgado, y finalmente llegan a la sala de láseres, replicada.

Alice, con un arma, apunta a Wesker en la cabeza, pero él le inyecta un suero que la priva de todos sus poderes súper humanos, incluyendo su telequinesis.

Alice le da las gracias por esto, ya que ahora es completamente humana otra vez.

Después de apenas escapar con vida, Alice vuela a Alaska para encontrar el helicóptero de Umbrella totalmente desierto, y el libro que le había dado anteriormente a K-Mart.

Luego, encuentra a Claire Redfield merodeando en el bosque, con un aparato de control mental que Umbrella le puso.

Alice destruye el aparato y se entera de que Claire ha perdido toda su memoria.

Una vez que aterrizan ahí, se topan con los sobrevivientes Chris Redfield -hermano de Claire-, Bennent, Kim Yong, Cristal, y Luther West.

En su intento de salida, no tardan en conocer al Verdugo, un zombi gigante, que opera una enorme hacha.

En esta entrega Alice fortalece su amistad con Claire volviéndose más cercanas en comparación a otros personajes de la saga.

Las fuerzas de Umbrella llegan a Arcadia y abren fuego sobre los sobrevivientes.

Wesker aparece en un monitor y Ada explica que ella y Wesker ya no trabajan para Umbrella como el superordenador de la Reina Roja ha hecho a cargo de la Corporación Umbrella.

Wesker informa a Alice que él ha enviado su ayuda en la forma de un equipo dirigido por Leon S. Kennedy y Luther, quién lo creyó muerto (en Afterlife), aún está vivo.

Un tiroteo se produce, lo que resulta en la captura de Ada, Alice y Becky escapan.

Alice asegura a la niña que ella es su madre y son atacados de nuevo por el Licker.

Un helicóptero llega para salvarlos, pero Alice se derrumba de sus heridas al ser llevada con Becky, Ada, Leon y Jill, Cuando se despierta, Alice es llevado a la Oficina Oval de la Casa Blanca en Washington.

Él le inyecta inmediatamente con una muestra del virus-T, que ha vuelto la espalda a sus habilidades sobrehumanas.

Alice despierta en la Casa Blanca ahora en ruinas, cuando todos evacuaron, después de haber sido traicionada una vez más por Wesker.

Alice más tarde llega a Raccoon City ahora destruida y es capturado por un grupo de sobrevivientes, que consiste en Doc, Abigail, Christian, Cobalt, Razor y Claire Redfield, que se revela de estar viva después del ataque a Arcadia.

El grupo más tarde se da cuenta de que una segunda horda está llegando en su dirección.

Al llegar a la colmena, la Reina Roja aparece ante Alice y explica la razón de su traición.

Isaacs planea eliminar a Alicia y obtener el control total de Umbrella, pero Alicia "despide" a Wesker, lo que indica que la Reina Roja para aplastar las piernas con una puerta de seguridad.

Un documento promocional lanzado por Screen Gems, llamado The Raccoon City Times, confirmó que Alice es un apodo y Janus Prospero es el verdadero nombre del personaje.

[2]​ Sin embargo, en la novela de Resident Evil: Apocalypse, se revela que su nombre es Alice Abernathy.

También, tiene la habilidad de saltar a grandes distancias, como se ve en su batalla inicial contra Nemésis.

En Resident Evil: Afterlife Alice tiene el control total sobre todos sus poderes sobrehumanos, que más tarde son sellados por una inyección proporcionada por el presidente Wesker, que destruye las células T. A partir de este momento Alice se ve forzada a sobrevivir sin sus poderes en la tierra la cual ahora es solo una roca muerta llena de zombis.