Su padre es el conocido escritor Aziz Nesin y su madre es Meral Çelen.
Entre 1977-1981, recibió una maestría en matemáticas de la Universidad Paris Diderot.
Ali Nesin, quien más tarde hizo su doctorado en lógica matemática y álgebra en la Universidad de Yale en los Estados Unidos, asistió a la Universidad de California entre 1985-1986.
Fue arrestado y juzgado por "incitar al ejército a la rebelión" porque se opuso a la vacunación de soldados rasos con la misma jeringa cuando vino a Turquía para el servicio militar de corta duración.
Nesin está casado con Özlem Beyarslan y tiene 4 hijos.