Es sobrino del cardenal Antonio María Rouco Varela.

Alfonso Carrasco Rouco estudió en Mondoñedo y Salamanca hasta 1975.

Posteriormente, se trasladó a Friburgo (Suiza), donde obtuvo la licenciatura en Teología en 1980.

Tras su doctorado, trabajó en la Diócesis de Mondoñedo-Ferrol hasta 1991, cuando se trasladó a Madrid.

Carrasco Rouco también colaboró con la Congregación para el Clero y formó parte de la Comisión Central del Tercer Sínodo Diocesano de Madrid.