Alejandro Lembo comenzó su carrera en el fútbol profesional debutando en 1997 en el Club Atlético Bella Vista de Montevideo.

Entre el año 2000 y el 2001 pasó al AC Parma de Italia, donde no llegó a sumar minutos.

En el 2001 volvió a Uruguay para jugar por primera vez en el Club Nacional de Football, equipo del cual se convertiría en un jugador emblemático, siendo campeón de la Primera División Uruguaya en los años 2000, 2001 y 2002.

Entre 2007 y 2008 volvió a Uruguay para jugar en el Danubio Fútbol Club de Montevideo, para luego volver a Europa y sumarse al plantel del Aris Salónica de Grecia, donde permaneció hasta el 2009.

Con la celeste contabilizó un total de 38 partidos, en los que anotó 2 goles.