Alcaligenes endophyticus es una especie de bacteria gramnegativa del género Alcaligenes.
[1] Es aerobia y móvil por flagelación perítrica.
Forma colonias de color amarillo claro, circulares, convexas y lisas en agar LB.
Catalasa y oxidasa positivas.
Se ha aislado de las raíces de la planta Ammodendron bifolium en el desierto Takeermohuer, China.