Ubicada sobre la costa oeste de la isla, la comuna propiamente dicha se extiende sobre la ribera norte del golfo de Ajaccio, entre la Gravona y las Islas Sanguinarias.

Numerosas playas y caletas bordean su territorio, sobre todo en la parte oeste, en la que está particularmente accidentada.

El punto de mayor altitud se encuentra a 790 metros sobre el nivel del mar.

Varias hipótesis han sido emitidas en cuanto al principio del nombre Ajaccio.

La más mitológica confiere la fundación de la ciudad al legendario héroe griego Áyax, que le habría dado su nombre.