Se encuentra en Ponte Spinola, en el antiguo puerto (siglo XVI) de la ciudad.
Para llegar, es posible tomar el metro en la estación de ferrocarriles y bajar en la estación de "San Giorgio".
En coche, salir da la autopista en "Genova Ovest".
Para visitar todo el museo se tarda unas dos horas y media.
El acuario de Génova toma parte al proyecto europeo AquaRing, un proyecto educativo sobre el mundo acuático.