Actualmente, está patrocinado por el Ayuntamiento de Granada y algunas entidades como la Obra Social de la Caixa.
Los objetivos del mismo son la divulgación del órgano y su música en sus vertientes concertística, pedagógica y divulgativa, así como el apoyo a los jóvenes organistas y la composición para órgano.
No obstante, la primera edición del festival con el nombre y funcionamiento actuales fue la de 2003, pasando a abarcar desde entonces todos los acontecimientos relacionados con el órgano que organiza la Real Academia.
A lo largo de estos años se han impartido clases magistrales por los profesores Monserrat Torrent (España), Enrico Viccardi (Italia), Henri Porteau (Francia), Georges Guillard (Francia) y Hans Fagius (Suecia).
Desde su fundación, han participado en la academia organistas de la talla de Juan María Pedrero, Georges Guillard, Esteban Landart, Enrico Viccardi, Antonio Linares, Javier Artigas, Michel Bouvard, Miguel Bernal Ripoll, Montserrat Torrent, Andrés Cea, Hilmar Gertschen, Henri Porteau, Hans Fagius, Concepción Fernández Vivas y Mónica Melcova, entre otros.