[2]​ Su nombre proviene del tegua, y significa lugar de capulines.

Santo Tomás Abiquiú fue fundado en 1742 por y para la corona española por el padre Francisco Delgado, que estableció como vecinos a 42 familias de indios teguas.

[5]​ Al concordarse la paz con comanches y yutas a finales del siglo XVIII, se estableció una feria anual en Abiquiú, que atrajo multitud de indios al pueblo.

Los yutas cambiaban pieles de venado por caballos y herramientas, mientras que los vecinos aprovechaban la ocasión para redimir o comprar niños cautivos.

Su derecho a las tierras se validó en 1894 ante los Estados Unidos, y en 1969 recibieron aun más tierra incluida en el antiguo otorgamiento que hasta entonces permanecía como un bosque nacional de los Estados Unidos.