En 1926, tomó la sucesión de Édouard Louis Trouessart a la cabeza de esa cátedra.
Participó en la creación del Parque Zoológico de París, inaugurado en 1934, en París, en el bosque de Vincennes.
Se especializó en los problemas de domesticación de animales y sus relaciones entre el Hombre prehistórico y los mamíferos cuaternarios.
Sus estudios de los animales domésticos gradualmente le hicieron interesarse en las formas silvestres.
La abreviatura Bourdelle se emplea para indicar a Édouard Bourdelle como autoridad en la descripción y taxonomía en zoología.