Los identificadores moleculares únicos ( UMI ), o códigos de barras moleculares ( MBC ), son secuencias cortas o "etiquetas" moleculares que se agregan a los fragmentos de ADN en algunos protocolos de preparación de bibliotecas de secuenciación de próxima generación para identificar la molécula de ADN de entrada. Estas etiquetas se agregan antes de la amplificación por PCR y se pueden usar para reducir los errores y el sesgo cuantitativo introducidos por la amplificación.
Las aplicaciones incluyen el análisis de ADNc únicos para evitar sesgos de PCR en iCLIP , [1] llamada de variantes en ctDNA , expresión genética en ARN-seq de una sola célula (scRNA-seq) [2] [3] y haplotipificación a través de lecturas vinculadas [ aclaración necesaria ] .
Véase también
Referencias
- ^ König, Julian; Zarnack, Kathi; Rot, Gregor; Curk, Tomaz; Kayikci, Melis; Zupan, Blaz; Turner, Daniel J.; Luscombe, Nicholas M.; Ule, Jernej (julio de 2010). "iCLIP revela la función de las partículas hnRNP en el empalme con resolución de nucleótidos individuales". Nature Structural & Molecular Biology . 17 (7): 909–915. doi :10.1038/nsmb.1838. ISSN 1545-9985. PMC 3000544 . PMID 20601959.
- ^ Kivioja T, Vähärautio A, Karlsson K, Bonke M, Enge M, Linnarsson S, Taipale J (2012). "Contar números absolutos de moléculas utilizando identificadores moleculares únicos". Nat. Métodos . 9 (1): 72–4. doi :10.1038/nmeth.1778. PMID 22101854. S2CID 39225091.
- ^ Islam S, Zeisel A, Joost S, La Manno G, Zajac P, Kasper M, Lönnerberg P, Linnarsson S (2014). "Secuenciación cuantitativa de ARN unicelular con identificadores moleculares únicos". Nat. Methods . 11 (2): 163–6. doi :10.1038/nmeth.2772. PMID 24363023. S2CID 6765530.
