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Convergencia de haplotipos

La convergencia de haplotipos es la aparición no relacionada de  haplotipos idénticos  en poblaciones separadas, ya sea mediante  evolución convergente  o azar.

Descripción

La convergencia de haplotipos es rara, debido a las enormes probabilidades de que dos individuos no relacionados evolucionen de forma independiente exactamente la misma secuencia genética en el sitio de interés. Por lo tanto, los haplotipos se comparten principalmente entre individuos muy estrechamente relacionados, ya que la información genética en dos individuos relacionados será mucho más similar que entre individuos no relacionados. [1] El sesgo de sustitución aumenta aún más la probabilidad de convergencia de haplotipos, ya que esto aumenta la probabilidad de que se produzcan mutaciones en el mismo sitio. [2] Las secuencias también pueden divergir de la misma secuencia original y luego revertirse, convergiendo de esta manera. [3] La convergencia a través de la evolución convergente en dos grupos no relacionados es mucho menos común, ya que los rasgos derivados pueden surgir a través de vías dramáticamente diferentes. [4] [5]

Determinar erróneamente que dos individuos son idénticos debido a la convergencia de haplotipos se vuelve mucho menos probable cuando se prueban más marcadores genéticos, ya que eso requeriría una mayor cantidad de coincidencias extremadamente raras. [6] Con los enfoques modernos de secuenciación de alto rendimiento, secuenciar un gran conjunto de marcadores, o incluso el genoma completo, es mucho más factible y minimiza en gran medida estos problemas. [7]

Ejemplos

En algunas regiones, debido a la baja diversidad en el gen Y-STR (a menudo utilizado para estudiar el origen del apellido), la convergencia de haplotipos puede confundir los análisis, concluyendo que los individuos no relacionados están muy estrechamente relacionados. [8]

De manera similar, un estudio de los haplogrupos de ADN mitocondrial del Nuevo Mundo observó que las similitudes en los haplotipos entre los nativos americanos y los asiáticos eran el resultado de la hipervariabilidad de la región HVSI en el ADN mitocondrial, más que de una ascendencia común. [2]

Como ejemplo de convergencia de haplotipos debido a la evolución convergente en grupos relacionados más distantes, el espinoso de tres espinas  en ambientes de aguas negras similares al antiguo  killis de aleta azul  y  la dorada evolucionaron de forma independiente el mismo haplotipo en el gen SWS2, que promueve una mejor vista en esas condiciones. [9]

Referencias

  1. ^ Brenner, Charles H. (1 de enero de 2014). "Comprensión de la probabilidad de coincidencia del haplotipo Y". Ciencia Forense Internacional: Genética . 8 (1): 233–243. doi :10.1016/j.fsigen.2013.10.007. PMID  24315614.
  2. ^ ab Malhi, Ripan S.; Eshleman, Jason A.; Greenberg, Jonathan A.; Weiss, Deborah A.; Sacudió, Beth A. Schultz; Kaestle, Frederika A.; Lorenz, José G.; Kemp, Brian M.; Johnson, John R. (1 de abril de 2002). "La estructura de la diversidad dentro de los haplogrupos de ADN mitocondrial del nuevo mundo: implicaciones para la prehistoria de América del Norte". La Revista Estadounidense de Genética Humana . 70 (4): 905–919. doi :10.1086/339690. PMC 379119 . PMID  11845406. 
  3. ^ Cairns, J.; Foster, PL (agosto de 1991). "Reversión adaptativa de una mutación por desplazamiento de marco en Escherichia Coli". Genética . 128 (4): 695–701. doi :10.1093/genética/128.4.695. ISSN  0016-6731. PMC 1204544 . PMID  1916241. 
  4. ^ Brenner, Charles H. (2014). "Comprensión de la probabilidad de coincidencia del haplotipo Y". Ciencia Forense Internacional: Genética . 8 (1): 233–243. doi :10.1016/j.fsigen.2013.10.007. PMID  24315614.
  5. ^ Stern, David L. (2013). "Las causas genéticas de la evolución convergente". Naturaleza Reseñas Genética . 14 (11): 751–764. doi :10.1038/nrg3483. ISSN  1471-0064. PMID  24105273. S2CID  15282549.
  6. ^ "Haplotipos comunes". ancestry.com. 14 de diciembre de 2006 . Consultado el 28 de marzo de 2012 .[ se necesita una mejor fuente ]
  7. ^ Blair, C.; Murphy, RW (1 de enero de 2011). "Tendencias recientes en el análisis filogenético molecular: ¿hacia dónde seguir?". Revista de herencia . 102 (1): 130-138. doi :10.1093/jhered/esq092. ISSN  0022-1503. PMID  20696667.
  8. ^ Solé-Morata, Neus; Villaescusa, Patricia; García-Fernández, Carla; Font-Porterías, Neus; Illescas, María José; Valverde, Laura; Tassi, Francesca; Ghirotto, Silvia; Férec, Claude (4 de agosto de 2017). "El análisis del haplogrupo R1b-DF27 muestra que una gran fracción de los linajes del cromosoma Y ibérico se originaron recientemente in situ". Informes científicos . 7 (1): 7341. Código bibliográfico : 2017NatSR...7.7341S. doi :10.1038/s41598-017-07710-x. ISSN  2045-2322. PMC 5544771 . PMID  28779148. 
  9. ^ Marqués, David A.; Taylor, John S.; Jones, Felicity C.; Palma, Federica Di; Kingsley, David M.; Reimchen, Thomas E. (11 de abril de 2017). "La evolución convergente de la opsina SWS2 facilita la radiación adaptativa del espinoso de tres espinas en diferentes entornos de luz". Más biología . 15 (4): e2001627. doi : 10.1371/journal.pbio.2001627 . ISSN  1545-7885. PMC 5388470 . PMID  28399148.