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Transpeptidasa clasificadora de proteínas

Una transpeptidasa clasificadora de proteínas es una enzima , como la sortasa SrtA [1] de Staphylococcus aureus , que escinde una o más proteínas diana producidas por la misma célula, como parte de una vía especializada de selección de proteínas . La transpeptidasa clasificadora de proteínas procariota típica se caracteriza por ser una proteasa , pero no simplemente hidroliza un enlace peptídico. En cambio, la porción N-terminal más grande del polipéptido escindido se transfiere a otra molécula, como un precursor de la pared celular de peptidoglicano en bacterias Gram-positivas .

El término sortasa se reserva apropiadamente para el conjunto de enzimas cisteína proteasas sortasa A , sortasa B y miembros de clases adicionales, todas las cuales comparten homología. Sin embargo, se ha descrito un número creciente de sistemas de clasificación de proteínas adicionales en procariotas, que involucran enzimas de clasificación que carecen de homología con la sortasa y que parecen haber surgido por separado por evolución convergente . Aunque las sortasas son los miembros mejor descritos de las transpeptidasas de clasificación de proteínas, se ha acumulado trabajo sobre las enzimas análogas arqueosortasa [2] , rombosortasa [3] y la enzima PorU de los sistemas de secreción de tipo IX (T9SS) [4] .

Las mixosortasas, homólogas de la proteasa prenil CAAX tipo 2 Rce1, son enzimas de clasificación de proteínas análogas, pero es poco probable que funcionen como transpeptidasas. [5] Es probable, en cambio, que el residuo de cisteína en la secuencia diana sea modificado por una enzima separada, y que esa modificación sea seguida por una escisión por la mixosortasa, como sucede con Rce1. La bioquímica exacta de la modificación general aún no se conoce.

Referencias

  1. ^ Zong Y, Bice TW, Ton-That H, Schneewind O, Narayana SV (2004). "Estructuras cristalinas de la sortasa A de Staphylococcus aureus y su complejo de sustrato". J Biol Chem . 279 (30): 31383–9. doi : 10.1074/jbc.M401374200 . PMID  15117963.
  2. ^ Abdul Halim MF, Rodriguez R, Stoltzfus JD, Duggin IG, Pohlschroder M (2018). "Los residuos conservados son críticos para la actividad catalítica de la arqueosortasa de Haloferax volcanii: implicaciones para la evolución convergente de los mecanismos catalíticos de las sortasas no homólogas de arqueas y bacterias". Mol Microbiol . 108 (3): 276–287. doi : 10.1111/mmi.13935 . PMID  29465796.
  3. ^ Gadwal S, Johnson TL, Remmer H, Sandkvist M (2018). "Procesamiento del extremo C de proteínas que contienen GlyGly-CTERM por rombosortasa en Vibrio cholerae". PLOS Pathog . 14 (10): e1007341. doi : 10.1371/journal.ppat.1007341 . PMC 6219818 . PMID  30352106. 
  4. ^ de Diego I, Ksiazek M, Mizgalska D, Koneru L, Golik P, Szmigielski B, et al. (2016). "La señal de exportación de la membrana externa del sistema de secreción tipo IX de Porphyromonas gingivalis (T9SS) es un dominio sándwich β C-terminal conservado". Sci Rep . 6 : 23123. doi :10.1038/srep23123. PMC 4804311 . PMID  27005013. 
  5. ^ DH Haft: descubrimiento de las mixosortasas que procesan MYXO-CTERM y tres nuevas señales de clasificación de proteínas C-terminales procariotas que comparten residuos de Cys invariantes. En: Journal of bacteriology. Band 206, No. 1, enero de 2024, S. e0017323, doi :10.1128/jb.00173-23, PMID 38084967, PMC  1081000.