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Lista de códigos genéticos

Si bien hay muchos puntos en común, las distintas partes del árbol de la vida utilizan códigos genéticos ligeramente diferentes . [1] Al traducir del genoma a la proteína, es esencial utilizar el código genético correcto. Los códigos mitocondriales son los ejemplos relativamente conocidos de variación. La siguiente tabla de traducción sigue la numeración y designación del NCBI. [2] Shulgina y Eddy descubrieron cuatro nuevos códigos genéticos alternativos en genomas bacterianos utilizando su software de asignación de codones Codetta, y los validaron mediante el análisis de anticodones de ARNt y elementos de identidad; [3] estos códigos no están adoptados actualmente en el NCBI, pero están numerados aquí del 34 al 37 y se especifican en la siguiente tabla.

  1. El código estándar
  2. El código mitocondrial de los vertebrados
  3. El código mitocondrial de la levadura
  4. El código mitocondrial de mohos, protozoos y celentéreos y el código de micoplasma/espiroplasma
  5. El código mitocondrial de los invertebrados
  6. El código nuclear de los ciliados, dasicladáceos y hexamitas
  7. Código del cinetoplasto eliminado ; cf. tabla 4.
  8. suprimido, cf. tabla 1.
  9. El código mitocondrial de los equinodermos y platelmintos
  10. El código nuclear euploide
  11. El código plastídico bacteriano, arqueológico y vegetal
  12. El código nuclear de la levadura alternativa
  13. El código mitocondrial de la ascidia
  14. El código mitocondrial alternativo del platelminto
  15. El código nuclear del blefarismo [4]
  16. El código mitocondrial clorofíceo
  17. (ninguno)
  18. (ninguno)
  19. (ninguno)
  20. (ninguno)
  21. El código mitocondrial del trematodo
  22. El código mitocondrial de Scenedesmus obliquus
  23. El código mitocondrial de Thraustochytrium
  24. El código mitocondrial de Pterobranchia
  25. La división candidata SR1 y el código gracilibacteria
  26. El código nuclear de Pachysolen tannophilus
  27. El código nuclear cariorélico
  28. El código nuclear del condilostoma
  29. El código nuclear del mesodinio
  30. El código nuclear del perítrico
  31. El código nuclear de Blastocrithidia
  32. El código de plástidos de Balanophoraceae (no se muestra en la web) [4] [5]
  33. El código mitocondrial de los Cephalodiscidae
  34. El código del Enterosoma [3]
  35. El código de Peptacetobacter [3]
  36. El código de Anaerococcus y Onthovivens [3]
  37. El código de Absconditabacterales [3]

Las tablas de traducción alternativas (2 a 37) implican reasignaciones de codones que se recapitulan en las tablas de codones de ADN y ARN .

Resumen de la tabla

Comparación de tablas de traducción alternativas para todos los codones (utilizando códigos de aminoácidos IUPAC ):

Notas

Tres tablas de traducción tienen un estado peculiar:

Otros mecanismos también juegan un papel en la biosíntesis de proteínas , como la modificación postranscripcional .

Referencias

  1. ^ Watanabe, Kimitsuna; Suzuki, Tsutomu (2001). "Código genético y sus variantes". Enciclopedia de ciencias de la vida . doi :10.1038/npg.els.0000810. ISBN 047001590X.
  2. ^ Elzanowski, Andrzej; Jim Ostell (7 de julio de 2010). "The Genetic Codes". Centro Nacional de Información Biotecnológica . Consultado el 6 de mayo de 2013 .
  3. ^ abcde Shulgina, Yekaterina; Eddy, Sean R. (9 de noviembre de 2021). "Un análisis computacional de códigos genéticos alternativos en más de 250.000 genomas". eLife . 10 . doi : 10.7554/eLife.71402 . PMC 8629427 . PMID  34751130. 
  4. ^ abc "Tabla de códigos genéticos del NCBI en formato ASN-1, con registro de cambios: gc.prt".
  5. ^ Su, Huei-Jiun; Barkman, Todd J.; Hao, Weilong; Jones, Samuel S.; Naumann, Julia; Skippington, Elizabeth; Wafula, Eric K.; Hu, Jer-Ming; Palmer, Jeffrey D.; DePamphilis, Claude W. (15 de enero de 2019). "Nuevo código genético y riqueza récord de AT en el genoma de plástidos altamente reducido de la planta holoparásita Balanophora". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 116 (3): 934–943. Bibcode :2019PNAS..116..934S. doi : 10.1073/pnas.1816822116 . PMC 6338844 . PMID  30598433. 

Véase también

Enlaces externos

Lectura adicional