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Proteína tetramérica

Dos subunidades de proteínas se unen para formar un dímero. Luego, dos dímeros se unen para formar el tetrámero final.
La formación del tetrámero de sorbitol deshidrogenasa a partir de sus monómeros mediante dímeros.

Una proteína tetramérica es una proteína con una estructura cuaternaria de cuatro subunidades (tetramérica). Los homotetrámeros tienen cuatro subunidades idénticas (como la glutatión S-transferasa ) y los heterotetrámeros son complejos de diferentes subunidades. Un tetrámero puede ensamblarse como un dímero de dímeros con dos subunidades homodímeras (como la sorbitol deshidrogenasa ) o dos subunidades heterodímeras (como la hemoglobina ).

Interacciones de subunidades en tetrámeros.

Las interacciones entre las subunidades que forman un tetrámero están determinadas principalmente por interacciones no covalentes . [1] Los efectos hidrofóbicos , los enlaces de hidrógeno y las interacciones electrostáticas son las fuentes principales de este proceso de unión entre subunidades. Para las proteínas homotetraméricas como la sorbitol deshidrogenasa (SDH), se cree que la estructura ha evolucionado pasando de una estructura monomérica a una dimérica y finalmente a una estructura tetramérica en la evolución. El proceso de unión en SDH y muchas otras enzimas tetraméricas puede describirse mediante la ganancia de energía libre que puede determinarse a partir de la tasa de asociación y disociación. [1] La imagen de arriba muestra el ensamblaje de las cuatro subunidades (A, B, C y D) en SDH.

Enlaces de hidrógeno entre subunidades.

Se ha demostrado que las redes de enlaces de hidrógeno entre subunidades son importantes para la estabilidad de la estructura de la proteína cuaternaria tetramérica . Por ejemplo, un estudio de SDH que utilizó diversos métodos, como alineamientos de secuencias de proteínas , comparaciones estructurales, cálculos de energía, experimentos de filtración en gel y experimentos de cinética enzimática, podría revelar una importante red de enlaces de hidrógeno que estabiliza la estructura cuaternaria tetramérica en la SDH de mamíferos . [1]

Tetrámeros en inmunología

En inmunología , los tetrámeros de MHC se pueden utilizar en ensayos de tetrámeros para cuantificar el número de células T específicas de antígeno (especialmente células T CD8+ ). Los tetrámeros del MHC se basan en moléculas recombinantes de clase I que, mediante la acción de la BirA bacteriana, han sido biotiniladas . Estas moléculas se pliegan con el péptido de interés y β2M y se tetramerizan mediante una estreptavidina marcada con fluorescencia . (La estreptavidina se une a cuatro biotinas por molécula). Este reactivo tetrámero marcará específicamente las células T que expresan receptores de células T que son específicos para un complejo péptido-MHC determinado. Por ejemplo, un tetrámero Kb/FAPGNYPAL se unirá específicamente a las células T citotóxicas específicas del virus Sendai en un ratón C57BL/6 . Las respuestas específicas de antígeno se pueden medir como células T CD8+, tetrámero+ como una fracción de todos los linfocitos CD8+.

La razón para utilizar un tetrámero, a diferencia de una única molécula MHC de clase I marcada, es que los tetrámeros tetraédricos pueden unirse a tres TCR a la vez, lo que permite la unión específica a pesar de la baja afinidad (1 micromolar) del péptido de clase I típico. -Interacción TCR. También se pueden fabricar tetrámeros de MHC clase II , aunque es más difícil trabajar con ellos en la práctica. [2]

Homotetrámeros y heterotetrámeros

Un complejo homotetramérico, beta-glucuronidasa (una glicosidasa ). Cada subunidad tiene la misma secuencia de aminoácidos .
La molécula heterotetramérica hemoglobina , formada por cuatro subunidades de dos tipos diferentes (de color rojo y azul ).

Un homotetrámero es un complejo proteico formado por cuatro subunidades idénticas que están asociadas pero no unidas covalentemente. [3] Por el contrario, un heterotetrámero es un complejo de 4 subunidades donde una o más subunidades difieren. [4]

Ejemplos de homotetrámeros incluyen:

Ejemplos de heterotetrámeros incluyen la hemoglobina ( en la foto ), el receptor NMDA , algunas acuaporinas , [7] algunos receptores AMPA y algunas enzimas . [8]

Purificación de heterotetrámeros.

La cromatografía de intercambio iónico es útil para aislar conjuntos de proteínas heterotetraméricas específicas, lo que permite la purificación de complejos específicos según el número y la posición de las etiquetas peptídicas cargadas. [9] [10] La cromatografía de afinidad por níquel también se puede emplear para la purificación de heterotetrámeros. [11]

Complementación intragénica

Múltiples copias de un polipéptido codificado por un gen a menudo pueden formar un agregado denominado multímero. Cuando se forma un multímero a partir de polipéptidos producidos por dos alelos mutantes diferentes de un gen particular, el multímero mixto puede exhibir una mayor actividad funcional que los multímeros no mezclados formados por cada uno de los mutantes solo. Cuando un multímero mixto muestra una mayor funcionalidad en relación con los multímeros no mezclados, el fenómeno se denomina complementación intragénica . En humanos, la argininosuccinato liasa (ASL) es una enzima homotetramérica que puede sufrir complementación intragénica. Un trastorno de ASL en humanos puede surgir de mutaciones en el gen ASL , particularmente mutaciones que afectan el sitio activo de la enzima tetramérica. El trastorno de ASL se asocia con una considerable heterogeneidad clínica y genética que se considera que refleja la amplia complementación intragénica que se produce entre diferentes pacientes individuales. [12] [13] [14]

Referencias

  1. ^ abc Hellgren M, Kaiser C, de Haij S, Norberg A, Höög JO (diciembre de 2007). "Una red de enlaces de hidrógeno en la sorbitol deshidrogenasa de mamíferos estabiliza el estado tetramérico y es esencial para el poder catalítico". Ciencias de la vida celulares y moleculares . 64 (23): 3129–3138. doi :10.1007/s00018-007-7318-1. PMID  17952367. S2CID  22090973.
  2. ^ Dolton G, Tungatt K, Lloyd A, Bianchi V, Theaker SM, Trimby A, et al. (Septiembre de 2015). "Más trucos con tetrámeros: una guía práctica para teñir células T con multímeros de péptido-MHC". Inmunología . 146 (1): 11-22. doi : 10.1111/imm.12499. PMC 4552497 . PMID  26076649. 
  3. ^ "Término GO: homotetramerización de proteínas". Genoma de la levadura. Archivado desde el original el 27 de septiembre de 2011 . Consultado el 14 de mayo de 2011 .
  4. ^ "Término GO: heterotetramerización de proteínas". Genoma de la levadura. Archivado desde el original el 27 de septiembre de 2011 . Consultado el 14 de mayo de 2011 .
  5. ^ Watanabe M, Blobel G (abril de 1989). "El factor citosólico purificado de Escherichia coli es necesario y suficiente para la exportación de una preproteína y es un homotetrámero de SecB". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 86 (8): 2728–2732. Código bibliográfico : 1989PNAS...86.2728W. doi : 10.1073/pnas.86.8.2728 . PMC 286991 . PMID  2649892. 
  6. ^ Warren MA, Kucharski LM, Veenstra A, Shi L, Grulich PF, Maguire ME (julio de 2004). "El transportador CorA Mg2+ es un homotetrámero". Revista de Bacteriología . 186 (14): 4605–4612. doi :10.1128/JB.186.14.4605-4612.2004. PMC 438605 . PMID  15231793. 
  7. ^ Neely JD, Christensen BM, Nielsen S, Agre P (agosto de 1999). "Composición heterotetramérica de los canales de agua de acuaporina-4". Bioquímica . 38 (34): 11156–11163. doi :10.1021/bi990941s. PMID  10460172.
  8. ^ Chang TH, Hsieh FL, Ko TP, Teng KH, Liang PH, Wang AH (febrero de 2010). "La estructura de una geranilpirofosfato sintasa heterotetramérica de la menta (Mentha piperita) revela la regulación entre subunidades". La célula vegetal . 22 (2): 454–467. doi :10.1105/tpc.109.071738. PMC 2845413 . PMID  20139160. 
  9. ^ Sakash JB, Kantrowitz ER (septiembre de 2000). "La contribución de las interacciones entre cadenas individuales a la estabilización de los estados T y R de la aspartato transcarbamoilasa de Escherichia coli". La Revista de Química Biológica . 275 (37): 28701–28707. doi : 10.1074/jbc.M005079200 . PMID  10875936.
  10. ^ Fairhead M, Krndija D, Lowe ED, Howarth M (enero de 2014). "Emparejamiento plug-and-play mediante estreptavidinas divalentes definidas". Revista de biología molecular . 426 (1): 199–214. doi :10.1016/j.jmb.2013.09.016. PMC 4047826 . PMID  24056174. 
  11. ^ Howarth M, Chinnapen DJ, Gerrow K, Dorrestein PC, Grandy MR, Kelleher NL, et al. (Abril de 2006). "Una estreptavidina monovalente con un único sitio de unión de biotina femtomolar". Métodos de la naturaleza . 3 (4): 267–273. doi : 10.1038/nmeth861. PMC 2576293 . PMID  16554831. 
  12. ^ Turner MA, Simpson A, McInnes RR, Howell PL (agosto de 1997). "Argininosuccinato liasa humana: una base estructural para la complementación intragénica". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 94 (17): 9063–9068. Código bibliográfico : 1997PNAS...94.9063T. doi : 10.1073/pnas.94.17.9063 . PMC 23030 . PMID  9256435. 
  13. ^ Yu B, Howell PL (octubre de 2000). "Complementación intragénica y estructura y función de la argininosuccinato liasa". Ciencias de la vida celulares y moleculares . 57 (11): 1637-1651. doi :10.1007/PL00000646. PMID  11092456. S2CID  1254964.
  14. ^ Yu B, Thompson GD, Yip P, Howell PL, Davidson AR (diciembre de 2001). "Mecanismos de complementación intragénica en el locus de argininosuccinato liasa humano". Bioquímica . 40 (51): 15581–15590. doi :10.1021/bi011526e. PMID  11747433.

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