termoanaerobacter

Género de bacterias

Thermoanaerobacter es un género del filo Bacillota ( Bacteria ). ^[1] Los miembros de este género son termófilos y anaeróbicos , varios de ellos fueron descritos previamente como especies de Clostridium y miembros de los ahora obsoletos géneros Acetogenium y Thermobacteroides ^{[2] [3]}

Etimología

El nombre Thermoanaerobacter deriva de: adjetivo
griego termo (θερμός) , caliente; Prefijo griego an (ἄν) , no; Sustantivo griego aer, eros (ἀήρ, ἀέρος) , aire; Sustantivo de género masculino neolatino , bacter , que nominalmente significa "una vara", pero en realidad significa una bacteria, vara; Sustantivo de género masculino neolatino Thermoanaerobacter , bastón que crece en ausencia de aire a temperaturas elevadas. ^[4]

Especies

El género contiene 15 especies, a saber ^[4]

• T. acetoetilicus (Ben-Bassat y Zeikus 1983) Rainey y Stackebrandt 1993 (sustantivo latino acetum , vinagre;adjetivo neolatino etílico , perteneciente al alcohol etílico;adjetivo neolatino de género masculino acetoetilicus , que pretende significar la producción de ácido acético y etanol. ) Esta especie, anteriormente conocida como Thermobacteroides acetoetilicus , solía ser la especie tipo de Thermobacteroides , pero fue transferida al género Thermoanaerobacter , mientras que el otro miembro del género Thermobacteroides , Thermobacteroides proteolyticus fue reclasificado como Coprothermobacter proteolyticus ^[3]
• T. brockii (Zeikus et al . 1983) Lee et al . 1993 (nombre de caso genitivo neolatino brockii , de Brock, llamado así por Thomas Dale Brock, quien fue pionero en estudios sobre la fisiología y ecología de los termófilos ). Esta especie se conocía anteriormente como Thermoanaerobium brockii ^{[5] [6]}
• T. etanolicus Wiegel y Ljungdahl 1982 (Especie tipo del género;sustantivo neolatino etanol , etanol;  género masculino latino suff. -icus , sufijo usado con el sentido de pertenecer a;adjetivo de género masculino neolatino tanolicus , que indica la producción de etanol.) ^[7]
• " T. inferii " Orlygsson y Beck 2007
• T. italicus Kozianowski et al . 1998 (Adjetivo latino de género masculino italicus , perteneciente a Italia, donde se aisló el organismo.) ^[8]
• " T. keratinophilus " Riesen y Antranikian 2001
• T. kivui (Leigh y Wolfe 1983) Collins et al . 1994 (Sustantivo de caso genitivo neolatino kivui , perteneciente a Kivu, llamado así por su fuente, el lago Kivu). Esta especie solía ser conocida como Acetogenium kivui (único miembro del género anterior) antes de ser transferida a este género ^[9]
• T. mathranii Larsen et al . 1998 (nombre de caso genitivo neolatino mathranii , de Mathrani, en honor al fallecido Indra M. Mathrani, quien contribuyó a la comprensión de los anaerobios termófilos de las aguas termales durante su corta carrera). ^{[10] [11]}
• T. pentosaceus Tomás, Karakashev y Angelidaki 2013 ^[12]
• T. pseudetanolicus Onyenwoke et al . [13 ] ​​​​​​​ ​​​​​​​​^​
• T. siderophilus Slobodkin et al . 1999 (sustantivo griego sideros , hierro;adjetivo neolatino philus deladjetivo griego philos (φίλος) que significa amigo, amoroso;adjetivo neolatino de género masculino siderophilus , amante del hierro.) ^[14]
• T. sulfurigignens Lee et al . 2007 ( sustantivo latino azufre , azufre; adjetivo de participio latino gignens , productor; adjetivo de participio neolatino sulfurigignens , productor de azufre.) ^[15]
• T. sulfurophilus Bonch-Osmolovskaya 1998 ( sustantivo latino azufre , azufre; adjetivo neolatino philus del adjetivo griego philos (φίλος) que significa amigo, cariñoso; adjetivo neolatino de género masculino sulfurophilus , gusto por el azufre elemental.) ^[16]
• T. thermocopriae (Jin, Yamasato y Toda 1988) Collins et al . 1994 (sustantivo griego thermē (θέρμη) , calor;sustantivo griego kopria , estercolero;sustantivo genitivo neolatino thermocopriae , de abono térmico.) Esta especie se conocía anteriormente como Clostridium thermocopriae ^[9]
• T. thermohidrosulfuricus (Klaushofer y Parkkinen 1965) Lee et al . 1993 ( adjetivo griego termo (θερμός) , caliente; adjetivo de género masculino neolatino hydrosulfuricus , perteneciente al sulfuro de hidrógeno; adjetivo de género masculino neolatino thermohidrosulfuricus , que indica que el organismo crece a altas temperaturas y reduce el sulfito a H ₂ S.), esta especie también solía ser Clostridium thermohidrosulfuricum ^[6]
• T. uzonensis Wagner et al . 2008 ( Adjetivo de género masculino neolatino uzonensis , perteneciente a la Caldera de Uzon, Kamchatka, Lejano Oriente de Rusia.) ^[17]
• T. wiegelii Cook et al . 1996 ( nombre de caso genitivo neolatino wiegelii , de Juergen Wiegel, en reconocimiento a sus contribuciones al estudio de los anaerobios termófilos). ^[18]

Tres antiguos miembros de este género, T. subterraneus , T. tengcongensis y T. yonseiensis , fueron reclasificados como subespecies de Caldanaerobacter subterraneus ^[19]

Filogenia

La taxonomía actualmente aceptada se basa en la Lista de nombres procarióticos con estatus en la nomenclatura (LPSN) ^[20] y el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) ^[21].

Ver también

• Taxonomía bacteriana
• Microbiología
• Lista de órdenes bacterianas
• Lista de géneros de bacterias

Referencias

1. Clasificación del género Thermoanaerobacter en LPSN ; Parte, Aidan C.; Sardà Carbasse, Joaquim; Meier-Kolthoff, Jan P.; Reimer, Lorenz C.; Göker, Markus (1 de noviembre de 2020). "La lista de nombres procarióticos con posición en la nomenclatura (LPSN) se traslada a la DSMZ". Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva . 70 (11): 5607–5612. doi : 10.1099/ijsem.0.004332 .
2. Collins, médico; Lawson, Pensilvania; Willems, A; et al. (1994). "La filogenia del género Clostridium: propuesta de cinco nuevos géneros y once nuevas combinaciones de especies". En t. J. Sistema. Bacteriol . 44 (4): 812–26. doi : 10.1099/00207713-44-4-812 . PMID  7981107.
3. Rainey, FA; Stackebrandt, E. (1993). "Transferencia de la especie tipo del género Thermobacteroides al género Thermoanaerobacter como Thermoanaerobacter acetoetilicus (Ben-Bassat y Zeikus 1981) comb. nov., descripción de Coprothermobacter gen. nov. y reclasificación de Thermobacteroides proteolyticus como Coprothermobacter proteolyticus (Ollivier et al. 1985) peine. En t. J. Sistema. Bacteriol . 43 (4): 857–859. doi : 10.1099/00207713-43-4-857 .
4. Thermoanaerobacter en LPSN ; Parte, Aidan C.; Sardà Carbasse, Joaquim; Meier-Kolthoff, Jan P.; Reimer, Lorenz C.; Göker, Markus (1 de noviembre de 2020). "La lista de nombres procarióticos con posición en la nomenclatura (LPSN) se traslada a la DSMZ". Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva . 70 (11): 5607–5612. doi : 10.1099/ijsem.0.004332 .
5. Zeikus, JG; Hegge, PW; Anderson, MA (1979). "Thermoanaerobium brockii gen. nov. y sp. nov., una nueva bacteria anaeróbica, caldoactiva y quimioorganotrófica". Archivos de Microbiología . 122 (1): 41–48. doi :10.1007/BF00408044.
6. Lee, YE; Jainista, MK; Lee, C.; Lowe, SE; Zeikus, JG (1993). "Distinción taxonómica de anaerobios termófilos sacarolíticos: descripción de Thermoanaerobacterium xylanolyticum gen. nov., sp. nov. y Thermoanaerobacterium saccharolyticum gen. nov., sp. nov.; reclasificación de Thermoanaerobium brockii, Clostridium thermosulfurogenes y Clostridium thermohidrosulfuricum E100-69 como Thermoanaerobacter brockii comb. nov., Thermoanaerobacterium thermosulfurigenes comb. y Thermoanaerobacter thermohidrosulfuricus nov., respectivamente y transferencia de Clostridium thermohidrosulfuricum 39E a Thermoanaerobacter etanolicus. Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva . 43 (1): 41–51. doi :10.1099/00207713-43-1-41.
7. Wiegel, JR; Ljungdahl, LG (1981). "Thermoanaerobacter etanolicus gen. Nov., spec. Nov., una nueva bacteria anaeróbica, termófila extrema". Archivos de Microbiología . 128 (4): 343–348. doi :10.1007/BF00405910.
8. Kozianowski, G.; Canganella, F.; Rainey, FA; Hippe, H.; Antranikian, G. (1997). "Purificación y caracterización de pectato-liasas termoestables de una bacteria termófila recién aislada, Thermoanaerobacter italicus sp. Nov". Extremófilos . 1 (4): 171–182. doi :10.1007/s007920050031. PMID  9680298.
9. Collins, MD; Lawson, Pensilvania; Willems, A.; Córdoba, JJ; Fernández-Garayzabal, J.; García, P.; Cai, J.; Hippe, H.; Farrow, JAE (1994). "La filogenia del género Clostridium: propuesta de cinco nuevos géneros y once nuevas combinaciones de especies". Revista Internacional de Bacteriología Sistemática . 44 (4): 812–826. doi : 10.1099/00207713-44-4-812 . ISSN  0020-7713. PMID  7981107.
10. Larsen, L.; Nielsen, P.; Ahring, BK (1997). "Thermoanaerobacter mathranii sp. nov., una bacteria anaeróbica extremadamente termófila productora de etanol de una fuente termal en Islandia". Archivos de Microbiología . 168 (2): 114-119. doi :10.1007/s002030050476. PMID  9238102.
11. "Lista de nuevos nombres y nuevas combinaciones previamente publicadas de manera efectiva, pero no válidamente". Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva . 57 (parte 1): 1. 2007. doi : 10.1099/ijs.0.64923-0 . PMID  17220429.
12. Tomás, AF; Karakashev, D.; Angelidaki, I. (2013). "Thermoanaerobacter pentosaceus sp. nov., una bacteria anaeróbica, extremadamente termófila y con alto rendimiento de etanol aislada de desechos domésticos". Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva . 63 (7): 2396–2404. doi :10.1099/ijs.0.045211-0. PMID  23178727.
13. Onyen despertó, RU; Kevbrin, VV; Lysenko, AM; Wiegel, J. (2007). "Thermoanaerobacter pseudetanolicus sp. nov., un anaerobio heterótrofo termófilo del Parque Nacional de Yellowstone". Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva . 57 (10): 2191–2193. doi : 10.1099/ijs.0.65051-0 . PMID  17911280.
14. Slobodkin, AI; Tourova, TP; Kuznetsov, BB; Kostrikina, NA; Chernyh, NA; Bonch-Osmolovskaya, EA (1999). "Thermoanaerobacter siderophilus sp. nov., una nueva bacteria termófila, anaeróbica y reductora de Fe (III) disimilatoria". Revista Internacional de Bacteriología Sistemática . 49 (4): 1471-1478. doi : 10.1099/00207713-49-4-1471 . PMID  10555328.
15. Lee, Y.-J.; Dashti, M.; Prange, A.; Rainey, FA; Rohde, M.; Whitman, WB; Wiegel, J. (2007). "Thermoanaerobacter sulfurigignens sp. nov., una bacteria termófila anaeróbica que reduce el tiosulfato 1 M a azufre elemental y tolera el sulfito 90 mM". Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva . 57 (7): 1429-1434. doi : 10.1099/ijs.0.64748-0 . PMID  17625170.
16. Bonch-Osmolovskaya, EA; Miroshnichenko, ML; Chernykh, NA; Kostrikina, NA; Pikuta, EV; Rainey, FA (1997). "Reducción de azufre elemental por bacterias organotróficas moderadamente termófilas y descripción de Thermoanaerobacter sulfurophilus sp. nov". Microbiología . 66 : 483–489.
17. Wagner, identificación; Zhao, W.; Zhang, CL; Romanek, CS; Rohde, M.; Wiegel, J. (2008). "Thermoanaerobacter uzonensis sp. nov., una bacteria termófila anaeróbica aislada de una fuente termal dentro de la caldera de Uzon, Kamchatka, Lejano Oriente de Rusia". Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva . 58 (11): 2565–2573. doi : 10.1099/ijs.0.65343-0 . PMID  18984694.
18. Cocinero, director general; Rainey, FA; Patel, BKC; Morgan, HW (1996). "Caracterización de un nuevo termófilo anaeróbico obligado, Thermoanaerobacter wiegelii sp. nov". Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva . 46 (1): 123-127. doi : 10.1099/00207713-46-1-123 . PMID  8573487.
19. Fardeau, M.; Salinas, M.; L'Haridon, S.; Jeanthon, C.; Verhé, F.; Cayol, J.; Patel, B.; García, J.; Ollivier, B. (2004). "Aislamiento de depósitos de petróleo de nuevos anaerobios termófilos filogenéticamente relacionados con Thermoanaerobacter subterraneus: reasignación de T. subterraneus, Thermoanaerobacter yonseiensis, Thermoanaerobacter tengcongensis y Carboxydibrachium pacificum a Caldanaerobacter subterraneus gen. nov., sp. nov., comb. nov. como cuatro nuevas subespecies ". Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva . 54 (2): 467–474. doi : 10.1099/ijs.0.02711-0 . PMID  15023962.
20. JP Euzéby. "Termoanaerobacteria". Lista de nombres procarióticos con posición en la nomenclatura (LPSN) . Consultado el 9 de septiembre de 2022 .
21. Repetidores; et al. "Termoanaerobacteria". Base de datos de taxonomía del Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) . Consultado el 9 de septiembre de 2022 .
22. "El LTP" . Consultado el 20 de noviembre de 2023 .
23. "Árbol LTP_all en formato newick" . Consultado el 20 de noviembre de 2023 .
24. "Notas de la versión LTP_08_2023" (PDF) . Consultado el 20 de noviembre de 2023 .
25. "Versión GTDB 08-RS214". Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 10 de mayo de 2023 .
26. "bac120_r214.sp_label". Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 10 de mayo de 2023 .
27. "Historia del taxón". Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 10 de mayo de 2023 .