La Primera División 2008-09 fue la decimocuarta temporada de la máxima categoría del fútbol andorrano . Comenzó el 21 de septiembre de 2008 y finalizó el 7 de mayo de 2009. El FC Santa Coloma fue el vigente campeón.
Los equipos participantes jugaron primero un sistema convencional de todos contra todos, en el que cada equipo jugaba contra cada oponente una vez en casa y otra fuera, para un total de 14 partidos. Luego, la liga se dividió en dos grupos de cuatro equipos, y cada uno de ellos jugó contra los equipos de su grupo en un ciclo de partidos de ida y vuelta. Los cuatro mejores equipos compitieron por el campeonato. Los cuatro últimos equipos jugaron por un puesto de descenso directo y un puesto de playoff de descenso. Los récords obtenidos en la primera ronda se trasladaron a las respectivas segundas rondas.
La Casa Estrella del Benfica descendió después de la última temporada al terminar en el octavo lugar. Fueron sustituidos por el campeón de la Segona Divisió, la UE Santa Coloma .
Además, UE Engordany y UE Extremenya , subcampeón de la Segona Divisió, jugaron un desempate de descenso a dos partidos. Engordany mantuvo su lugar en Primera Divisió al ganar 5-3 en el global.
El Inter Club d'Escaldes compitió en un play-off de descenso a dos partidos contra el Atlètic Club d'Escaldes , subcampeón de la Segona Divisió , por un puesto en la Primera Divisió 2009-10 . El Inter retuvo con éxito su puesto en Primera Divisió tras ganar en los penaltis 10–9.