La temporada 1939-1940 fue la 67ª temporada de fútbol competitivo en Escocia. Habría sido la temporada número 50 de la Liga Escocesa de Fútbol , pero el estallido de la Segunda Guerra Mundial el 3 de septiembre de 1939 provocó la suspensión de la liga después de cinco rondas de partidos disputados en la División Uno y cuatro rondas en la División Dos. La liga no se compitió oficialmente hasta la temporada 1946-1947, pero se jugaron ligas regionales durante estos años.
La Liga Escocesa suspendió oficialmente su competición el 13 de septiembre de 1939 y creó un comité para investigar la posibilidad de competiciones de liga regionales. Estas fueron aprobadas el 26 de septiembre después de que el Ministro del Interior concediera el permiso y comenzaron un mes después. Había dos divisiones; oriental y occidental; cada uno consta de 16 clubes. Esto dejó a seis de los clubes de la liga anterior; Montrose , Brechin City , Forfar Athletic , Leith Athletic , Edimburgo City y East Stirlingshire .
Cowdenbeath dimitió a mitad de temporada, habían jugado contra todos los demás clubes una vez y por eso se permitió que se mantuviera su récord. La competición se completó con un desempate entre los dos ganadores divisionales, que eran los Rangers y Falkirk, los Rangers ganaron 2-1 en Ibrox Park .