El Comité Internacional de Taxonomía de Virus ( ICTV ) autoriza y organiza la clasificación taxonómica y la nomenclatura de los virus . [1] [2] [3] El ICTV desarrolla un esquema taxonómico universal para los virus y, por lo tanto, tiene los medios para describir, nombrar y clasificar adecuadamente cada taxón de virus. Los miembros del Comité Internacional de Taxonomía de Virus se consideran virólogos expertos . [4] El ICTV se formó a partir de la División de Virología de la Unión Internacional de Sociedades de Microbiología y está gobernado por ella . [5] El trabajo detallado, como la identificación de nuevos taxones y la delimitación de los límites de especies, géneros, familias, etc., normalmente lo realizan grupos de estudio de expertos en las familias. [2]
El Comité Internacional de Nomenclatura de Virus (ICNV) se estableció en 1966, en el Congreso Internacional de Microbiología en Moscú, para estandarizar la denominación de los taxones de virus. [6] El ICVN publicó su primer informe en 1971. [6] Para los virus que infectan vertebrados , el primer informe incluyó 19 géneros, 2 familias y otros 24 grupos no clasificados. [ cita requerida ]
En 1974, el ICNV pasó a llamarse Comité Internacional de Taxonomía de Virus. [6]
La organización está dividida en un comité ejecutivo, que incluye miembros y ejecutivos con funciones electas por un período determinado, así como jefes de siete subcomités designados directamente. Cada jefe de subcomité, a su vez, designa numerosos "grupos de estudio", cada uno de los cuales consta de un presidente y un número variable de miembros dedicados a la taxonomía de un taxón específico, como un orden o una familia. Esta estructura puede visualizarse de la siguiente manera: [7]
Los objetivos del Comité Internacional de Taxonomía de Virus son: [8] : §3
Los principios esenciales de nomenclatura de virus del ICTV son: [9] : §2.1
El sistema de clasificación universal de virus del ICTV utiliza una versión ligeramente modificada del sistema de clasificación biológica estándar . Sólo reconoce el orden de taxones , la familia, la subfamilia, el género y la especie. Cuando no se sabe con certeza cómo clasificar una especie en un género pero su clasificación en una familia es clara, se la clasifica como especie no asignada de esa familia. Muchos taxones permanecen sin clasificar. También hay, a fecha de 2005, secuencias de GenBank asignadas a 3.142 "especies" que no se contabilizan en el informe del ICTV (sin embargo, debido a la forma en que funciona GenBank, el número real de especies adecuadas es probablemente significativamente menor). [2] Se espera que el número de secuencias de virus no identificadas aumente a medida que la tasa de secuenciación de virus aumente drásticamente. [2][actualizar]
El ICTV ha tenido un éxito sorprendente en lograr estabilidad desde su creación en 1962. Por ejemplo, todos los géneros y familias reconocidos en la década de 1980 seguían utilizándose en 2005. [2]
Las propuestas de nombres nuevos, cambios de nombres y establecimiento y ubicación taxonómica de taxones son manejadas por el comité ejecutivo del ICTV en forma de propuestas. Todos los subcomités y grupos de estudio pertinentes del ICTV son consultados antes de tomar una decisión. [9] : §3.8,3.19
El nombre de un taxón no tiene estatus oficial hasta que haya sido aprobado por el ICTV, y los nombres sólo serán aceptados si están vinculados a taxones jerárquicos aprobados. [9] : §2.4,3.7 Si no se propone un nombre adecuado para un taxón, el taxón puede ser aprobado y el nombre puede dejarse sin decidir hasta la adopción de un nombre internacional aceptable, cuando uno es propuesto y aceptado por el ICTV. [ cita requerida ] Los nombres no deben transmitir un significado para el taxón que parezca excluir virus que son legítimamente miembros de ese taxón, excluir miembros que algún día podrían pertenecer a ese taxón, o incluir virus que son miembros de diferentes taxones. [9] : §3.17
No existe un principio de prioridad para la virología, de modo que un nombre en uso actual no puede invalidarse reivindicando prioridad. [9] : §3.10
Desde 2020, [10] el Código Viral exige el uso de nombres binomiales para las nuevas especies: un género seguido de un epíteto específico. [9] : §3.21 El nombre de una especie debe proporcionar una identificación apropiadamente inequívoca de la especie. [9] : §3.22
Antes de esa fecha, estaba en vigor un sistema de denominación más liberal: el nombre de una especie debe constar de la menor cantidad de palabras posible, pero no debe constar únicamente de un nombre de hospedante y la palabra virus . Se pueden utilizar números, letras o combinaciones de los mismos como epítetos de especie cuando dichos números y letras ya se utilizan ampliamente. Sin embargo, los números de serie, letras o combinaciones de los mismos recientemente designados no son aceptables por sí solos como epítetos de especie. Si ya existe una serie de números o letras, se puede continuar. [ cita requerida ]
Un género de virus es un grupo de especies relacionadas que comparten algunas propiedades significativas y a menudo difieren solo en el rango de hospedadores y la virulencia. El nombre de un género debe ser una sola palabra que termine en el sufijo - virus . La aprobación de un nuevo género debe ir acompañada de la aprobación de una especie tipo . [9] : §3.24
Una subfamilia es un grupo de géneros que comparten ciertos caracteres comunes. El taxón se utilizará únicamente cuando sea necesario para resolver un problema jerárquico complejo. El nombre de una subfamilia debe ser una sola palabra que termine con el sufijo - virinae . [9] : §3.24
Una familia es un grupo de géneros, ya sea que estén organizados en subfamilias o no, que comparten ciertos caracteres comunes entre sí. Un apellido debe ser una sola palabra que termine en el sufijo -viridae . [ 9] : §3.24
Un orden es un grupo de familias que comparten ciertos caracteres comunes. El nombre de un orden debe ser una sola palabra que termine con el sufijo -virales . [ 9] : §3.24
Las reglas relativas a la clasificación de los virus se aplicarán también a la clasificación de los viroides . Las terminaciones formales para los taxones de viroides son la palabra viroid para las especies, el sufijo -viroid para los géneros, el sufijo -viroinae para las subfamilias, en caso de que se necesite este taxón, y -viroidae para las familias. [9] : §3.26 Se utiliza un sistema similar para los satélites y los viriformes, sustituyendo -vir- en las terminaciones normales de los taxones por -satellit- y -viriform- . [9] : §3.26 [ ¿cuándo? ]
Los retrotransposones se consideran virus en cuanto a clasificación y nomenclatura. Los priones no se clasifican como virus, sino que se les asigna una clasificación arbitraria que parece útil para los investigadores de los campos específicos. [ cita requerida ]
Reconociendo la importancia de la metagenómica viral, el ICTV reconoce que los genomas ensamblados a partir de datos metagenómicos representan virus reales y fomenta su clasificación oficial siguiendo los mismos procedimientos que los utilizados para los virus aislados y caracterizados utilizando enfoques de virología clásica. [12] [13]
El ICTV ha publicado informes sobre la taxonomía de los virus aproximadamente dos veces por década desde 1971 (enumerados a continuación: "Informes"). El noveno informe del ICTV se publicó en diciembre de 2011; [14] el contenido ahora está disponible de forma gratuita a través del sitio web del ICTV. [15] A partir de 2017, el décimo informe del ICTV se publicará en línea en el sitio web del ICTV [16] [17] y será de acceso gratuito con capítulos individuales actualizados de forma continua. La taxonomía de 2018 está disponible en línea, [18] incluida una hoja de cálculo de Excel descargable de todas las especies reconocidas.
ICTVdb es una base de datos de especies y aislados que se ha diseñado para servir como complemento de la base de datos de taxonomía ICTV. El desarrollo de ICTVdB ha sido apoyado por ICTV desde 1991 y su objetivo inicial era ayudar a la investigación taxonómica. La base de datos clasifica los virus basándose principalmente en sus características químicas, tipo genómico , replicación de ácidos nucleicos , enfermedades, vectores y distribución geográfica, entre otras características. [ cita requerida ]
La base de datos fue desarrollada en la Universidad Nacional de Australia con el apoyo de la Fundación Nacional de Ciencias de los Estados Unidos y patrocinada por la Colección Americana de Cultivos Tipo . Utiliza el sistema de Lenguaje de Descripción para Taxonomía ( DELTA ), un estándar mundial para el intercambio de datos taxonómicos, desarrollado en la Organización de Investigación Científica e Industrial de la Commonwealth (CSIRO) de Australia. DELTA puede almacenar una amplia diversidad de datos y traducirlos a un lenguaje adecuado para informes tradicionales y publicaciones web. Por ejemplo, ICTVdB no contiene en sí información de secuencia genómica, pero puede convertir datos de DELTA al formato NEXUS. [19] También puede manejar grandes entradas de datos y es adecuado para compilar largas listas de propiedades de virus, comentarios de texto e imágenes.
ICTVdB ha crecido en concepto y capacidad hasta convertirse en un importante recurso de referencia y herramienta de investigación; en 1999 recibía más de 30.000 visitas en línea combinadas por día desde su sitio principal en la Universidad Nacional de Australia y dos sitios espejo con sede en el Reino Unido y Estados Unidos. [20]
En 2011, el ICTV decidió suspender el proyecto y el sitio web ICTVdb. Esta decisión se tomó después de que se hizo evidente que la taxonomía proporcionada en el sitio estaba desactualizada hace muchos años y que parte de la información del sitio era inexacta debido a problemas con la forma en que se consultaba y procesaba la base de datos para respaldar la salida en lenguaje natural del sitio web ICTVdb. El ICTV comenzó a debatir sobre la mejor manera de solucionar estos problemas, pero decidió que el plazo para las actualizaciones y la corrección de errores era lo suficientemente largo como para que fuera mejor cerrar el sitio en lugar de perpetuar la publicación de información inexacta. [ cita requerida ] A partir de agosto de 2013, la base de datos permanece suspendida. [3] Según algunas opiniones, "ICTV también debería promover el uso de una base de datos pública para reemplazar la base de datos ICTV como un almacén de los metadatos primarios de virus individuales, y debería publicar resúmenes de los Informes ICTV en esa base de datos, para que sean de 'Acceso abierto'". [3] La base de datos se restableció en 2017. [17]
Agotado
Y aunque el ICTV dice que un cambio en el nombre formal del virus de la viruela del mono podría producirse en el próximo año o dos, la revisión no sería una respuesta al brote actual. En cambio, es parte de una amplia revisión de las convenciones de nomenclatura para todas las especies de virus, incluida la viruela del mono, después de que el ICTV adoptara cambios en 2020 para estandarizar su formato de nomenclatura.
SIN ETIQUETA (P1076) (ver usos )Resumen: El Comité Internacional de Taxonomía de Virus ha cambiado recientemente su definición aprobada de especie viral y también ha interrumpido el trabajo en su base de datos de descripción de virus.
