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Sitio de unión de NTP

Un sitio de unión de NTP es un tipo de sitio de unión que se encuentra en las quinasas de monofosfato de nucleósido (NMP) , N puede ser adenosina o guanosina . Un bucle P es uno de los motivos estructurales comunes para los sitios de unión de trifosfato de nucleósido (NTP), interactúa con los grupos fosforilo del nucleótido unido . Para que el sitio de unión pueda unirse a un nucleótido, el nucleótido debe estar unido de manera compleja a Mg 2+ o Mn 2+ . La unión de nucleótidos provocará cambios conformacionales en la proteína porque el bucle P se doblará.

Los sitios de unión de NTP desempeñan un papel en la replicación del ARN del poliovirus . [1] En la polimerasa dependiente del ARN del poliovirus, también conocida como 3D pol , hay dos sitios de unión. Ambos sitios de unión contienen residuos de lisina; sin embargo, solo la lisina en la posición 61 es esencial para la elongación de la secuencia de ARN como parte del proceso de replicación. [2] Además, se ha utilizado un método conocido como mutagénesis computacional de alanina para encontrar las porciones clave dentro de las secuencias de aminoácidos que caracterizan principalmente un sitio de unión de NTP en particular; estas regiones dentro de la secuencia se conservan. [3]

Referencias

  1. ^ Richards, Oliver C.; Ehrenfeld, Ellie (12 de septiembre de 1997). "Uno de los dos sitios de unión de NTP en la ARN polimerasa del virus de la poliomielitis necesarios para la replicación del ARN". Journal of Biological Chemistry . 272 ​​(37): 23261–23264. doi : 10.1074/jbc.272.37.23261 . PMID  9287335.
  2. ^ Richards, OC; Ehrenfeld, E. (12 de septiembre de 1997). "Uno de los dos sitios de unión de NTP en la ARN polimerasa del virus de la poliomielitis necesarios para la replicación del ARN". The Journal of Biological Chemistry . 272 ​​(37): 23261–23264. doi : 10.1074/jbc.272.37.23261 . ISSN  0021-9258. PMID  9287335.
  3. ^ Bhagavat, Raghu; Srinivasan, Narayanaswamy; Chandra, Nagasuma (25 de mayo de 2017). "Descifrando los principios de reconocimiento comunes de la unión de nucleósidos mono/di y trifosfatos en diversas proteínas a través de la correspondencia estructural de sus sitios de unión: motivos de unión de nucleótidos". Proteínas: estructura, función y bioinformática . 85 (9): 1699–1712. doi :10.1002/prot.25328. PMID  28547747. S2CID  39976832.