Los ARN pequeños específicos del cuerpo de Cajal ( scaRNA ) son una clase de ARN nucleolares pequeños (snoRNA) que se localizan específicamente en el cuerpo de Cajal , un orgánulo nuclear (suborgánulo celular) involucrado en la biogénesis de las ribonucleoproteínas nucleares pequeñas (snRNP o snurps). Los scaRNA guían la modificación ( metilación y pseudouridilación ) de los ARN espliceosomales transcritos por la ARN polimerasa II U1 , U2 , U4 , U5 y U12 .
El primer scaRNA identificado fue el U85. [1] Se diferencia de los snoRNA típicos en que es un snoRNA compuesto de caja C/D y caja H/ACA y puede guiar tanto la pseudouridilación como la 2'- O -metilación. No todos los scaRNA son snoRNA compuestos de caja C/D y H/ACA y la mayoría de los scaRNA son estructural y funcionalmente indistinguibles de los snoRNA, dirigiendo la modificación del ARN ribosómico (ARNr) en el nucléolo .
Varios estudios identificaron scaRNAs en Drosophila . [1] [2] [3] [4] [5] Uno de los estudios mostró que varios scaRNAs de Drosophila podrían funcionar igualmente bien en el nucleoplasma de moscas mutantes que carecen de cuerpos de Cajal. [4] Investigaciones posteriores mostraron que el scaRNA pugU6-40 se dirige al snRNA U6, cuya modificación ocurre en el nucléolo, no en CB, y que pugU1-6 y pug U2-55 guían 2 ARN: snRNA y 28s rRNA. [5]
En biología molecular , el ARN 1 específico de los cuerpos de Cajal pequeños (también conocido como SCARNA1 o ACA35) es un ARN nucleolar pequeño que se encuentra en los cuerpos de Cajal y se cree que está involucrado en la pseudouridilación del ARN espliceosómico U2 en el residuo U89.
El scaRNA1 es un ARN no codificante , que son productos funcionales de genes que no se traducen en proteínas . Estas moléculas de ARN suelen contener una estructura secundaria importante o motivos de unión a ligandos y están implicadas en muchos procesos biológicos importantes en la célula. [6]
scaRNA1 pertenece a la clase de caja H/ACA de snoRNA, ya que tiene la estructura horquilla-bisagra-horquilla-cola prevista, motivos de caja H/ACA conservados y se encuentra asociado con la proteína GAR1 . [7]