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Cronobacter sakazakii

Cronobacter sakazakii , que antes de 2007 se denominaba Enterobacter sakazakii , [2] [3] es una bacteria patógena oportunista, gramnegativa , con forma de bastón ,que puede vivir en lugares muy secos, un fenómeno conocido como xerotolerancia . C. sakazakii utiliza varios genes para sobrevivir a la desecación [4] y esta xerotolerancia puede ser específica de la cepa. [5] La mayoría de los casos de C. sakazakii son adultos, pero los neonatos prematuros de bajo peso al nacer y los bebés mayores son los que corren el mayor riesgo. El patógeno es una causa rara de infección invasiva en bebés, con tasas de letalidad históricamente altas (40-80%). [6] [7] [8] [9]

En los lactantes puede causar bacteriemia , meningitis y enterocolitis necrotizante . La mayoría de los casos de infecciones neonatales por C. sakazakii se han asociado con el uso de fórmula infantil en polvo [7] [9] con algunas cepas capaces de sobrevivir en estado desecado durante más de dos años. [10] Sin embargo, no todos los casos se han relacionado con fórmula infantil contaminada. En noviembre de 2011, se retiraron del mercado varios envíos de tampones Kotex debido a una contaminación con Cronobacter ( E. sakazakii ). En un estudio, el patógeno se encontró en el 12% de las verduras de campo y en el 13% de las verduras hidropónicas. [11] [12]

Todas las especies de Cronobacter , excepto C. condimenti , se han relacionado retrospectivamente con casos clínicos de infección en adultos o lactantes. Sin embargo, la tipificación de secuencias de loci múltiples [13] ha demostrado que la mayoría de los casos de meningitis neonatal en los últimos 30 años, en seis países, se han asociado con un solo linaje genético de la especie Cronobacter sakazakii llamado "Secuencia Tipo 4" o "ST4", [14] y, por lo tanto, este clon parece ser el de mayor preocupación en lo que respecta a las infecciones infantiles.

La bacteria es ubicua y se aísla de una variedad de ambientes y alimentos; la mayoría de los casos de Cronobacter ocurren en la población adulta. Sin embargo, es la asociación con fórmulas en polvo contaminadas intrínsecamente o extrínsecamente lo que ha atraído la atención principal. Según el análisis de secuencias de loci múltiples (MLSA), el género se originó hace unos 40 millones de años y la especie más significativa clínicamente, C. sakazakii , fue distinguible hace unos 15-23 millones de años. [15]

Taxonomía

E. sakazakii fue definida como especie en 1980 por JJ Farmer III et al . [1] La hibridación ADN-ADN mostró que E. sakazakii estaba relacionada en un 53-54% con especies de dos géneros diferentes, Enterobacter y Citrobacter . Sin embargo, se describieron diversos biogrupos dentro de E. sakazakii y Farmer et al. sugirieron que estos pueden representar especies diferentes y requieren más investigación para su aclaración. [1]

La relación taxonómica entre las cepas de E. sakazakii se ha estudiado mediante la secuenciación completa del gen 16S rRNA , hibridación ADN-ADN, tipificación de secuencias multilocus (MLST), f- AFLP y ribotipificación automatizada . Esto dio como resultado la clasificación de E. sakazakii como un nuevo género, Cronobacter dentro de Enterobacteriaceae , que inicialmente comprendía cuatro especies nombradas en 2007. La taxonomía se amplió a cinco especies nombradas en 2008 y, más recientemente (2011), a siete especies nombradas. [2] [3] [16]

Las cuatro especies nombradas inicialmente en 2007 fueron Cronobacter sakazakii (que comprende dos subespecies), C. turicensis , C. muytjensii y C. dublinensis (que comprende tres subespecies) más una especie sin nombre denominada Cronobacter genomospecies I. La taxonomía fue revisada en 2008 para incluir una quinta especie nombrada C. malonaticus , que en 2007 había sido considerada como una subespecie de C. sakazakii . En 2012, Cronobacter genomospecies I fue formalmente renombrada Cronobacter universalis , y una séptima especie fue descrita llamada Cronobacter condimenti .

Etimología

El primer aislamiento documentado de lo que se conocería como Cronobacter sakazakii fue de una lata de leche en polvo en 1950, aunque estos organismos probablemente han existido durante millones de años. En 1980, John J. Farmer III, propuso el nombre Enterobacter sakazakii para lo que se había conocido como "E. cloacae de pigmentación amarilla", en honor al bacteriólogo japonés Riichi Sakazaki. Durante las siguientes décadas, E. sakazakii estuvo implicada en decenas de casos de meningitis y sepsis entre bebés, frecuentemente en asociación con fórmula infantil en polvo. En 2007, se creó el género Cronobacter para dar cabida a los biogrupos de E. sakazakii , con C. sakazakii como especie tipo. El género recibió el nombre de Cronos , el titán de la mitología griega, que devoraba a sus hijos cuando nacían. [17]

Referencias

  1. ^ abc Farmer JJ III, Asbury MA, Hickman FW, Brenner DJ (1980). "Enterobacter sakazakii: una nueva especie de "Enterobacteriaceae" aislada de muestras clínicas". Int J Syst Bacteriol . 30 (3). el Enterobacteriaceae Study Group (EE. UU.): 569–84. doi : 10.1099/00207713-30-3-569 .
  2. ^ ab Iversen C; Mullane N; Bárbara McCardell; et al. (2008). "Cronobacter gen. nov., un nuevo género para dar cabida a los biogrupos de Enterobacter sakazakii, y propuesta de Cronobacter sakazakii gen. nov. comb. nov., C. malonaticus sp. nov., C. turicensis sp. nov., C. muytjensii sp., C. dublinensis nov., Cronobacter genomoespecie 1, y de tres subespecies, C. dublinensis nov. subsp. nov. y C. dublinensis nov. Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva . 58 (6): 1442–7. doi : 10.1099/ijs.0.65577-0 . PMID  18523192. S2CID  6609941.
  3. ^ ab Joseph; et al. (2011). "Cronobacter condimenti sp. nov., aislado de carne condimentada y Cronobacter universalis sp. nov., una nueva designación de especie para la genoespecie 1 de Cronobacter sp., recuperada de una infección en la pierna, agua e ingredientes alimentarios". Int J Syst Evol Microbiol . 62 (Pt 6): 1277–83. doi : 10.1099/ijs.0.032292-0 . PMID  22661070.
  4. ^ Srikumar S, Cao Y, Yan Q, Van Hoorde K, Nguyen S, Cooney S, Gopinath GR, Tall BD, Sivasankaran SK, Lehner A, Stephan R, Fanning S (enero de 2019). "Resumen transcripcional basado en secuenciación de ARN de la xerotolerancia en Cronobacter sakazakii SP291". Microbiología aplicada y ambiental . 85 (3). Código Bibliográfico :2019ApEnM..85E1993S. doi :10.1128/AEM.01993-18. PMC 6344630 . PMID  30446557. 
  5. ^ Cao Y, Dever K, Van Hoorde K, Sivasankaran SK, Nguyen SV, Macori G, Naithani A, Gopinath GR, Tall B, Lehner A, Stephan R, Srikumar S, Fanning S (noviembre de 2021). "Las alteraciones en el panorama transcripcional permiten una tolerancia diferencial a la desecación en Cronobacter sakazakii clínico". Microbiología aplicada y ambiental . 87 (24): e0083021. Bibcode :2021ApEnM..87E.830C. doi :10.1128/AEM.00830-21. PMC 8612285 . PMID  34644165. 
  6. ^ Hunter, Catherine J.; Petrosyan, Mikael; Ford, Henri R.; Prasadarao, Nemani V. (28 de abril de 2017). "Enterobacter sakazakii: un patógeno emergente en lactantes y neonatos". Infecciones quirúrgicas . 9 (5): 533–539. doi :10.1089/sur.2008.006. ISSN  1096-2964. PMC 2579942 . PMID  18687047. 
  7. ^ ab Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades (CDC) (abril de 2002). "Infecciones por Enterobacter sakazakii asociadas con el uso de fórmula infantil en polvo - Tennessee, 2001". MMWR. Informe semanal de morbilidad y mortalidad . 51 (14): 297–300. PMID  12002167.Texto completo gratuito
  8. ^ Lai KK (marzo de 2001). "Infecciones por Enterobacter sakazakii en neonatos, lactantes, niños y adultos. Informes de casos y una revisión de la literatura". Medicina . 80 (2): 113–22. doi : 10.1097/00005792-200103000-00004 . PMID  11307587. S2CID  7515008.
  9. ^ ab Bowen AB, Braden CR (agosto de 2006). "Enfermedad invasiva por Enterobacter sakazakii en lactantes". Enfermedades infecciosas emergentes . 12 (8): 1185–9. doi :10.3201/eid1208.051509. PMC 3291213. PMID  16965695 . 
  10. ^ Caubilla-Barron J, Forsythe S (2007). "Estrés seco y tiempo de supervivencia de Enterobacter sakazakii y otras Enterobacteriaceae en fórmulas infantiles deshidratadas". Journal of Food Protection . 13 : 467–472.
  11. ^ Ueda, Shigeko (1 de enero de 2017). "Presencia de Cronobacter spp. en alimentos secos, verduras frescas y suelo". Biocontrol Science . 22 (1): 55–59. doi : 10.4265/bio.22.55 . ISSN  1884-0205. PMID  28367871.
  12. ^ "Retirada del mercado de tampones Kotex por parte de la FDA". Seeger Weiss LLP. 16 de noviembre de 2011. Archivado desde el original el 5 de septiembre de 2014. Consultado el 29 de febrero de 2012 .
  13. ^ Baldwin; et al. (2009). "La tipificación de secuencias de loci múltiples de Cronobacter sakazakii y Cronobacter malonaticus revela estructuras clonales estables con importancia clínica que no se correlacionan con los biotipos". BMC Microbiology . 9 : 223. doi : 10.1186/1471-2180-9-223 . PMC 2770063 . PMID  19852808. 
  14. ^ Joseph y Forsythe (2011). "Asociación de Cronobacter sakazakii ST4 con infecciones neonatales". Enfermedades infecciosas emergentes . 17 (9): 1713–5. doi :10.3201/eid1709.110260. PMC 3322087 . PMID  21888801. 
  15. ^ Joseph S, Sonbol H, Hariri S, Desai P, McClelland M, Forsythe SJ (septiembre de 2012). "Diversidad del género Cronobacter revelada por la tipificación de secuencias multilocus". Journal of Clinical Microbiology . 50 (9): 3031–9. doi :10.1128/JCM.00905-12. PMC 3421776 . PMID  22785185. 
  16. ^ Iversen C, Lehner A, Mullane N, Bidlas E, Cleenwerck I, Marugg J, Fanning S, Stephan R, Joosten H (2007). "La taxonomía de Enterobacter sakazakii: propuesta de un nuevo género Cronobacter gen. nov. y descripciones de Cronobacter sakazakii comb. nov. Cronobacter sakazakii subsp. sakazakii, comb. nov., Cronobacter sakazakii subsp. malonaticus subsp. nov., Cronobacter turicensis sp. nov., Cronobacter muytjensii sp., Cronobacter dublinensis nov. y Cronobacter genomospecies 1". Biología Evolutiva del BMC . 7 (1): 64. Código bibliográfico : 2007BMCEE...7...64I. doi : 10.1186/1471-2148-7-64 . PMC: 1868726. PMID:  17439656 . Texto completo gratuito
  17. ^ Henry, Ronnie (noviembre de 2018). "Etimología: Cronobacter sakazakii". Emerg Infect Dis . 24 (11): 2124. doi : 10.3201/eid2411.et2411 . PMC 6199989 . 

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