El riboswitch SAM-II es un elemento de ARN que se encuentra predominantemente en Alphaproteobacteria y que se une a la S-adenosil metionina (SAM). [1] Su estructura y secuencia parecen no estar relacionadas con el riboswitch SAM que se encuentra en las bacterias Gram-positivas . Este riboswitch SAM se encuentra aguas arriba de los genes metA y metC en Agrobacterium tumefaciens y otros genes de biosíntesis de metionina y SAM en otras alpha-proteobacteria. Al igual que el otro riboswitch SAM, probablemente funciona para desactivar la expresión de estos genes en respuesta a niveles elevados de SAM. Una variante significativa de los riboswitches SAM-II se encontró en Pelagibacter ubique y bacterias marinas relacionadas y se denominó SAM-V . [2] Además, como muchos ARN estructurados, los riboswitches SAM-II pueden tolerar bucles largos entre sus tallos. [3]
El riboswitch SAM-II es corto, con menos de 70 nucleótidos y estructuralmente es relativamente simple, estando compuesto por una única horquilla y un pseudonudo .