retroposón

Árbol filogenético de marsupiales derivado de datos de retroposones ^[1]

Los retroposones son fragmentos de ADN repetitivos que se insertan en los cromosomas después de haber sido transcritos de forma inversa a partir de cualquier molécula de ARN .

Diferencia entre retroposones y retrotransposones

A diferencia de los retrotransposones , los retroposones nunca codifican la transcriptasa inversa (RT) (pero ver más abajo). Por tanto, son elementos no autónomos respecto a la actividad de transposición (a diferencia de los transposones ). Los retrotransposones de repetición terminal no larga (LTR), como los elementos LINE1 humanos , a veces se denominan falsamente retroposones. Sin embargo, esto depende del autor. Por ejemplo, Howard Temin publicó la siguiente definición: Los retroposones codifican RT pero carecen de repeticiones terminales largas (LTR), por ejemplo, elementos intercalados largos (LINE). Los retrotransposones también presentan LTR y los retrovirus , además, están empaquetados como partículas virales (viriones). Las retrosecuencias son elementos no autónomos que carecen de RT. Se retroponen con la ayuda de la maquinaria de elementos autónomos, como los LINE; ejemplos son elementos nucleares cortos intercalados (SINE) o retro(pseudo)genes derivados de ARNm . ^{[2] [3] [4]}

Duplicaciones genéticas

La retroposición representa aproximadamente 10.000 eventos de duplicación de genes en el genoma humano, de los cuales aproximadamente entre el 2% y el 10% probablemente sean funcionales. ^[5] Estos genes se denominan retrogenes y representan un determinado tipo de retroposón.

Transferencia genética horizontal

Un evento clásico es la retroposición de una molécula de pre-ARNm empalmada del gen c-Src en el ancestro proviral del virus del sarcoma de Rous (RSV). El pre-ARNm c-src retropuesto todavía contenía un único intrón y dentro del RSV ahora se denomina gen v-Src . ^[6]

Referencias

1. Nilsson, MA; Churakov, G.; Sommer, M.; et al. (2010). "Seguimiento de la evolución marsupial mediante inserciones de retroposones genómicos arcaicos". Más biología . 8 (7): e1000436. doi : 10.1371/journal.pbio.1000436 . PMC  2910653 . PMID  20668664.
2. Temin HM (1989). "Retrones en bacterias". Naturaleza . 339 (6222): 254–5. Código Bib :1989Natur.339..254T. doi : 10.1038/339254a0 . PMID  2471077. S2CID  29368479.
3. Makałowski W, Toda Y (2007). "Modulación de genes hospedadores por elementos transponibles de mamíferos". En Volff JN, Schmid M (eds.). Evolución de genes y proteínas . Dinámica del genoma. vol. 3 (3ª ed.). Basilea: S. Karger. pag. 166. doi : 10.1159/000107610. ISBN 978-3-8055-8341-1. OCLC  729848415. PMID  18753791.
4. Makałowski W, Gotea V, Pande A, Makałowska I (2019). "Elementos transponibles: clasificación, identificación y su uso como herramienta para la genómica comparada". En Anisimova M (ed.). Genómica Evolutiva . Métodos en biología molecular. vol. 1910. Clifton, Nueva Jersey. págs. 185–86. doi : 10.1007/978-1-4939-9074-0_6 . ISBN 978-3-8055-8341-1. OCLC  145014779. PMID  31278665.{{cite book}}: Mantenimiento CS1: falta el editor de la ubicación ( enlace )
5. Emerson JJ, Kaessmann H, Betrán E, Long M (enero de 2004). "Amplio tráfico genético en el cromosoma X de los mamíferos". Ciencia . 303 (5657): 537–40. Código Bib : 2004 Ciencia... 303.. 537E. doi : 10.1126/ciencia.1090042. PMID  14739461. S2CID  41158232.
6. Swanstrom, R; Parker, RC; Varmus, ÉL; Obispo, JM (mayo de 1983). "Transducción de un oncogén celular: la génesis del virus del sarcoma de Rous". Procedimientos de la Academia Nacional de Ciencias . 80 (9): 2519–2523. doi : 10.1073/pnas.80.9.2519 . PMC 393857 . PMID  6302692.